Транскриптомика клеточной культуры Polypedilum vanderplankii Pv11: поиск генов, определяющих устойчивость к обезвоживаниюНИР

Источник финансирования НИР

грант РФФИ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 4 августа 2014 г.-4 декабря 2014 г. Транскриптомика клеточной культуры Polypedilum vanderplankii Pv11: поиск генов, определяющих устойчивость к обезвоживанию
Результаты этапа: Целью данного исследования стало выявление генов, участвующих в адаптации клеточной культуры хирономиды Pv11 к обезвоживанию и характеристика их уровня экспрессии на различных этапах высыхания. Для этого культура клеток обезвоживалась в течении 48 ч с дальнейшей регидратацией. Контрольные точки, на которых осуществляли выделение тотальной РНК для создания библиотек: D00 – нормальное состояние, до обезвоживания; D06, D08, D10 – точки через соответствующее количество часов высушивания; R03, R24 – точки отбора при регидратации. Для каждой точки проводили выделение РНК в двух повторностях. После оценки качества РНК проводили приготовление библиотек для транскриптомного анализа, с помощью набора реагентов TruSeq RNA Sample Preparation Kit v2 (Illumina) и затем образцы секвенировались на HiSeq 2000. Были выявлены гены, активирующиеся в ответ на инкубацию с трегалозой (более 300 генов), среди наиболее сильно повысивших экспресию – цистеинлвые и сериновые пептидазы, тиоредоксин-подобные белки, протеин-метилтрансферазы. При высушивании активировались другие гены, прежде всего белков теплового шока.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".