Исследование и разработка алгоритмов и методов построения трехмерных атомистических моделей молекул белков и их комплексов на основе анализа карт электронной плотности низкого разрешения, молекулярного моделирования и баз данных по пространственной структуре гомологовНИР

Источник финансирования НИР

ФЦП: Федеральная целевая программа, Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы» научно-исследовательские работы (далее – работы) по лоту шифр «2012-1.4-07-514-0037

Этапы НИР

# Сроки Название
1 6 июня 2012 г.-25 ноября 2012 г. Выбор направления исследований
Результаты этапа: 1.1. Аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы, затрагивающей научно-техническую проблему, исследуемую в рамках НИР, в том числе обзор научных информационных источников: статьи в ведущих зарубежных и (или) российских научных журналах, монографии и (или) патенты) должен охватывать не менее 25 научно-информационных источников за период 2006 – 2012 гг. 1.2. Обоснование выбора направления и методики исследований. 1.2.1. Обоснование выбора платформ, 1.2.2. Обоснование выбора аппаратных средств, 1.2.3. Обоснование выбора средств разработки программ, 1.2.4. Обоснование выбора способов представления данных. 1.3. Разработка методов и алгоритмов обработки информации в области представления и анализа экспериментальных данных о распределении электронной плотности в биомакромолекулах и их комплексах. 1.4. Исследование и разработка алгоритмов и методов эффективной стерео визуализации и пространственной манипуляции моделями молекулярных объектов для реализации задач визуального докинга макромолекулярных структур 1.5. Исследование и разработка алгоритмов и методов анализа, визуализации и конвертации карт электронной плотности биомакромолекул 1.6. Разработка промежуточного отчёта о НИР 1.7. Проведение патентных исследований в соответствии ГОСТ Р 15.011-96. 1.8. Реализация мероприятий по достижению программных индикаторов и показателей (п. 8.2 ТЗ) 1.9. Разработка отчетной документации в соответствии с требованиями технического задания и актов Заказчика.
2 1 января 2013 г.-15 мая 2013 г. Теоретические исследования поставленных перед НИР задач
Результаты этапа: 2.1 Исследование методов и создание набора тестовых карт электронной плотности биомакромолекул различного разрешения на основе ряда биомакромолекул с известной структурой 2.2 Исследование и разработка алгоритмов характеристики формы биомакромолекул и последующего сравнительного анализа 2.3 Исследование и разработка алгоритмов выравнивания белковых доменов на основании информации о их форме. 2.4 Исследование и разработка алгоритмов поиска гомологичных белковых доменов сходных по форме в базах данных пространственных структур белков. 2.5. Исследование и разработка методик макромолекулярного докинга основанного на молекулярно-механических моделях белковых доменов. 2.6. Разработка методов и алгоритмов анализа и интеграции данных рентгеновского рассеяния, электронной микроскопии и методов молекулярного моделирования для исследования структуры и динамики биомакромолекул и их комплексов. 2.7. Реализация мероприятий по достижению программных индикаторов и показателей (п. 8.2 ТЗ) 2.8. Разработка промежуточного отчета о НИР. 2.9. Разработка отчетной документации в соответствии с требованиями технического задания и актов Заказчика.
3 16 мая 2013 г.-11 июля 2013 г. Экспериментальные исследования поставленных перед НИР задач
Результаты этапа: 3.1. Обобщение и оценка полученных результатов, в том числе: 3.1.1 обобщение результатов исследований; 3.1.2 сопоставление анализа научно-информационных источников и результатов теоретических и экспериментальных исследований; 3.1.3 оценка эффективности полученных результатов в сравнении с современным научно-техническим уровнем; 3.1.4 анализ выполнения требований ТЗ на НИР; 3.1.5 оценка полноты решения задач и достижения поставленных целей НИР. 3.2. Разработка проекта технического задания на НИР по теме «Разработка алгоритмов анализа и интеграции данных рентгеновского рассеяния от единичных молекул с использованием лазеров на свободных электронах и методов молекулярного моделирования для исследования структуры и динамики биомакромолекул и их комплексов» 3.3. Реализация мероприятий по достижению программных индикаторов и показателей (п. 8.2 ТЗ) 3.4. Разработка заключительного отчета о НИР. 3.5. Разработка отчетной документации в соответствии с требованиями технического задания и актов Заказчика.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".