| Результаты этапа: 1. Для выстраивания инфраструктуры работы в рамках данного проекта частично организован локальный инструментальный центр общемузейского пользования («Дигитариум») для оцифровки типовых экземпляров, их этикеток и соответствующей литературы. Центр включает 1 микроскоп «ЛОМО», стереомикроскоп с тринокулярным тубусом Olympus SZX10 и встроенным фотоаппаратом, штатив с цифровой фотокамерой Pentax K-100. В ходе тестовой эксплуатации этого центра выяснилось, что, учитывая архитектуру фондохранилищ Зоологического музея, потенциально высокую уязвимость дальнего перемещения коллекционных материалов и наличие элементов инфраструктуры на рабочих местах потенциальных пользователей, более эффективным и рациональным будет организация мобильного комплекса с возможностью рассредоточенного использования разных его составляющих.
2. Разработана общая структура базы данных по типовым экземплярам коллекции Зоологического музея МГУ, которая включает следующие основные блоки (см. Приложение 1):
2.1. Классификационный блок, включает 10 полей, содержит сведения о положении типифицируемых таксонов в иерархически организованной классификации многоклеточных животных (Metazoa);
2.2. Номенклатурный блок, включает 15 полей, содержит сведения о номенклатурном статусе самих типовых экземпляров (исходное и последующие изменения), о номенклатурном статусе типифицированных названий, о публикациях, позволяющих определить исходное и последующие трактовки номенклатурного статуса экземпляров и названий;
2.3. Коллекционный блок, включает 52 поля, содержит сведения о музейном статусе типовых экземпляров, их «физическом» состоянии, их коллекционных идентификаторах, их исследовании и др.;
2.4. Исследовательский блок, включает 8 полей, содержит информацию об исследовании типовых экземпляров;
2.5. Библиографический блок, включает 14 полей, содержит библиографию публикаций, основанных на изучении типовых экземпляров, включённых в данную ТБД;
2.6. Дополнительный ссылочный блок, включает 3 поля, обеспечивает связь библиографии и экземпляра
2.7. Изографический блок, включает 3 поля, содержит привязанные ссылки на оцифрованные изображения типовых экземпляров и их этикеток;
2.8. Блок «Управление пользователями», включает 5 полей, содержит технические сведения об авторах занесённых/изменённых данных.
Разработанная структура может быть использована при составлении баз данных в других музеях, хранящих типовые коллекции, а при некотором упрощении — также фондовых (не типовых) коллекций; последнее предусмотрено для фондовой коллекции ЗММГУ.
В качестве клиента базы данных использован php-клиент phpMyAdmin.
На языке php написан тестовый интерфейс для демонстрации базы данных в сети Интернет (http://zmmu.msu.ru/spec/index.php). Интерфейс позволяет навигацию по иерархической биологической системе, от уровня типов до вида и конкретного типового экземпляра. Возможно введение фильтров по наличию/отсутствию оцифрованных pdf публикаций и/или цифровых иллюстраций. Также существует возможность поиска по типифицированному названию. Интерфейс позволяет оценить работоспособность базы данных в режиме реального времени.
Разработан иерархический 6-уровневый таксономический классификатор для таксонов, включенных в базы данных. Классификатор включает названия таксонов следующих категорий: тип, класс, отряд, семейство род, вид. В него пока включены только таксоны, которые представлены в типовой коллекции ЗММГУ.
3. Содержательное наполнение базы данных (см. Приложение 2):
3а. Внесены заново или импортированы из существующих электронных таблиц сведения о типовых экземплярах, хранящихся в коллекции Зоологического музея МГУ: в общей сложности в единую базу данных включены сведения о 1902 типовых экземплярах зоологических таксонов, хранящихся в Зоологическом музее МГУ, из 3 типов (ARTHROPODA, MOLLUSCA, VERTEBRATA), 6 классов, 25 отрядов, 202 семейств, 581 родов и 1351 видов.
3б. Оцифрованы и подключены к базе данных изображения типовых экземпляров и/или их этикеток: в общей сложности 1115 фотографий.
3в. Осуществлена «привязка» типовых местонахождений по географическим координатам к существующей Интернет-интегрированной карте из ресурса Google: в общей сложности привязаны типовые локалитеты 519 экземпляров.
3г. Отсканированы и подключены к базе данных публикации с первоописаниями в форме PDF-файлов: 276 публикаций; в общей сложности привязана библиография по 637 публикациям.
|
| Результаты этапа: Внесено в базу данных - 414 записей (представители типов Molluska, Echinodermata, Arthropoda, Chordata)
Верифицировано ранее внесённых данных - 710 записей (представители типов Molluska, Arthropoda)
Выполнена оцифровка типовых экземпляров - 1372 экз. (представители типов Echinodermata, Arthropoda, Chordata)
Выполнена оцифровка публикаций с первоописаниями - 136 шт. (представители типов Echinodermata, Arthropoda, Chordata)
Выполнена привязка типовых локалитетов к электронной гео-карте - 1251 гео-точек (представители типов Arthropoda, Chordata) |
| Результаты этапа: Проект разрабатывался в рамках фундаментальной проблемы эффективного использования научных систематических биоколлекций как комплексного информационного ресурса для изучении биоразнообразия. Основной задачей проекта было создание и размещение в Интернете электронной интегрированной базы данных (БД) по научной типовой коллекции Зоологического музея МГУ как ключевого ресурса для изучения биоразнообразия животных. В результате реализации проекта разработана оригинальная структура 8-компонентной БД для хранения и обслуживания информации о типовых экземплярах зоологических таксонов. Сделан интерфейс для внешних пользователей, позволяющий проводить поиск типовых экземпляров и номинальных таксонов по различным параметрам. Сделан десктоп-интерфейс для внутреннего пользователя, позволяющий оператору вносить и редактировать информацию по всем 8-ми компонентам БД. БД реализована в реляционной системе MySQL. Разработана схема ключей, оптимизирующих хранение, целостность и скорость доступа к информации в таблицах БД. Внешний доступ к БД осуществляется посредством веб-интерфейса, реализованного в связке php-js-MySQL. Интерфейс интегрирован в официальный сайт Зоологического музея МГУ (http://zmmu.msu.ru/dbs/). При Научно-исследовательском зоологическом музее МГУ им. М.В. Ломоносова организован локальный инструментальный центр коллективного пользования («Дигитариум») для оцифровки типовых экземпляров, их этикеток и соответствующей литературы. В электронную БД по типовой коллекции Зоологического музея МГУ внесены в общей сложности оцифрованные данные по 5360 типовым экземплярам, относящимся к 7 типам, 20 классам, 68 отрядам многоклеточных животных (Metazoa). Разработанная в рамках проекта БД существенно информативнее своих аналогов. |
