StructAlign – ПРОГРАММА ДЛЯ ВЫРАВНИВАНИЯ СТРУКТУР ДНК БЕЛКОВЫХ КОМПЛЕКСОВстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.
Аннотация:Сравнительный анализ структур комплексов гомологичных белков с ДНК важен для анализа узнавания
ДНК белками. Необходимый этап сравнительного анализа – выравнивание, т.е. установление соответствия аминокислотных остатков и нуклеотидов одного комплекса аминокислотным остаткам и нуклеотидам другого. В настоящий момент доступных программ для выравнивания структур ДНК белковых комплексов не существует. Мы представляем программу StructAlign, которая призвана заполнить этот пробел. В качестве входных данных программа принимает две структуры комплексов двойной спирали ДНК с белками и выдает выравнивание цепей ДНК, отвечающее наилучшему пространственному совмещению цепей белка.