|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Параллельные G-квадруплексы, образованные гуанин-богатыми микросателлитными повторами, ингибируют человеческую топоизомеразу Iстатья
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 3 февраля 2022 г.
- Авторы: Оглоблина А.М., Банникова В.А., Христич А.Н., Орецкая Т.С., Якубовская М.Г., Долинная Н.Г.
- Журнал: Biochemistry (Moscow)
- Том: 80
- Номер: 8
- Год издания: 2015
- Издательство: Pleiades Publishing, Ltd
- Местоположение издательства: Road Town, United Kingdom
- Первая страница: 1224
- Последняя страница: 1239
- Аннотация: В работе методами УФ-спектроскопии и КД определена термодинамическая стабильность и структура G-квадруплексов (G4), образуемых G-богатыми фрагментами микросателлитов человека, которые отличаются числом остатков гуанозина в повторяющейся единице. Показано, что олигонуклеотиды d(GGGT)4 и d(GGT)4 образуют внутримолекулярные параллельные G4, причем температура плавления G-квадруплекса резко уменьшается (более чем на 45о) при переходе от трех- к битетрадным структурам. Повторы d(GT)n не образуют совершенных G4 (одна G-тетрада); элементы такой G-квадруплексной структуры не устойчивы при комнатной температуре и не стабилизируются ионами одновалентных металлов. Для олигонуклеотида d(GGT)4 определена минимальная концентрация ионов К+, способствующая фолдингу квадруплекса, которая, как оказалось, зависит от поддерживающей концентрации ионов Na+. Впервые показано, что при параллельной ориентации цепей в четырехцепочечной структуре фланкирующие G4-мотив комплементарные участки (в олигонуклеотиде d(CACTGG-CC-(GGGT)4-TA-CCAGTG)) не могут образовать двойную спираль из-за стерической удаленности, а только дестабилизируют G-квадруплекс. Изучено влияние охарактеризованных олигонуклеотидов на активность топоизомеразы I, одного из основных клеточных ферментов, и прослежена взаимосвязь между стабильностью образуемых ими квадруплексов и степенью ингибирования фермента. Наиболее активным ингибитором с IC50 равной 0.08 μМ оказался олигонуклеотид d(CACTGG-CC-(GGGT)4-TA-CCAGTG), в котором фланкирующие G4-мотив последовательности уменьшали устойчивость сверхпрочной квадруплексной структуры, образованной d(GGGT)4.
- Добавил в систему: Долинная Нина Германовна