Исследование разнообразия грибов в донных грунтах с помощью морфолого-культуральных и молекулярно-генетических методов (на примере Чукотского морятезисы доклада

Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 20 апреля 2016 г.

Работа с тезисами доклада


[1] Бубнова Е. Н., Коновалова О. П. Исследование разнообразия грибов в донных грунтах с помощью морфолого-культуральных и молекулярно-генетических методов (на примере Чукотского моря // Глава 5. Биоразнообразие грибов России и Евразии (DOI: 10.14427/cmr.2015.v.05.). Ред.: Ю.Т. Дьяков, Ю.В. Сергеев. Материалы III Международного Микологического форума. Москва. 14-15 апреля 2015 г. — Т. 4 из Современная микология в России. — Национальная Академия микологии Москва, 2015. — С. 141–143. Исследовано разнообразие грибов в 22 образцах донных грунтов Чукотского моря с применением морфолого-культуральных и молекулярно-генетических методов. Обнаружено, что при относительно небольшой численности, микобиота исследованных грунтов довольно разнообразна.Из одного образца выделялось от 1 до 9 морфотипов. При этом большинство из них были представлены 1-4 колониями. Ожидаемо много представителей рода Penicillium. Они преобладают как по численности, так и по разнообразию: 45 колоний 8 видов, выделены из 19 образцов. Вид Scopulariopsis hibernica был выделен из 3 образцов, общим числом 7 колоний, а два вида из рода Cladosporium – 12 колоний из 6 образцов. 19 морфотипов не дали в культуре никаких спороношений, поэтому были включены в молекулярно-генетический анализ. При его использовании далеко не все морфотипы удалось идентифицировать до уровня вида. Таких, хорошо идентифицированных, морфотипов оказалось только 12. Три из них были стерильными, остальные давали в культуре различные спороношения. Три из идентифицированных таким образом видов относятся к базидиальным грибам (Trametes versicolor и Bjerkandera adusta из порядка Polyporales и Sistotrema raduloides из порядка Corticiales), остальные – к различным порядкам аскомицетов. Что касается тех морфотипов, которые не удалось точно идентифицировать даже с помощью молекулярных методов, то один из них отнесён к базидиомицетам (Psilocybe sp. KRP22, изначально стерильный), а остальные – различным порядкам аскомицетов. Число порядков, при использовании молекулярных методов, увеличилось на два. Кроме того, применение молекулярных методов привело нас к заключению о более широком, чем предполагалось, распространении представителей порядка Helotiales (частично из стерильных) и Pleosporales (также частично из стерильных). Несколько морфотипов могли быть идентифицированы только до уровня порядка (например, Helotiales sp. WMM-2012c isolate 24m, или Uncultured soil fungus clone RS5M5c23P из Pleosporales). Это связано с явной недостаточностью информации, содержащейся в базах данных, в частности, в ГенБанке. Несомненно, применение молекулярных методов существенно расширяет наши представления о разнообразии грибов в донных грунтах арктических морей, а также о соотношении различных групп грибов. Учитывая, что стерильные морфотипы очень часто выделяются из донных грунтов, молекулярные техники – реальный способ разобраться с их таксономическим положением. Вместе с тем, недостаток данных в базах не позволяет сделать это со 100% точностью. Но, вместе с тем, и открывает широчайшее поле для дальнейших исследований. Во-первых – это, несомненно, полезная работа по дополнению уже имеющихся баз и коллекций. И во-вторых – возможное описание новых видов, гены которых уже были ранее обнаружены в других субстратах. И самое увлекательное – соединение культуральных и молекулярных техник для более полного описания разнообразия микобиоты. [ DOI ]

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть