Аннотация:В статье предлагается методика отбора организаций для предоставления бюджетных субсидий на реализацию инновационных проектов. Основой методики является оценка значения интегрального показателя эффективности предоставления субсидий. Интегральный показатель эффективности предоставления субсидий является синтетическим показателем, который формируется путем агрегирования локальных показателей с учетом их весовых коэффициентов и позволяет оценить комплексный уровень инновационного развития организации. Также в работе предлагается алгоритм оптимального распределения ограниченной суммы государственной поддержки между приоритетными организациями.