Аннотация:В статье на основе опыта отечественных фондов, поддерживающих фундаментальные научные исследования, изложены принципы построения организационно-экономического механизма, позволяющего осуществить финансирование начальных этапов инновационной деятельности. Предложены варианты перевода российской экономики на инновационный путь развития, рассмотрены методы взаимодействия науки и производства, особенности концепции открытых инноваций. Обоснованы подходы к отбору для финансирования наиболее перспективных для коммерциализации научных результатов, определены критерии оценки инновационного потенциала научно-исследовательского учреждения, выполнен анализ работы ученых и специалистов по проектам, ориентированным на получение инновационного продукта фундаментальных исследований.