Функциональная характеристика нокаутных клеток, полученных методом нокина GPI‑заякоренных эпитопных таговстатьяТезисы
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 21 мая 2019 г.
Аннотация:Для технологий редактирования генома с использованием CRISPR/Cas9 свойственна проблема off-target эффектов, т.е. разрезание ДНК вне целевого гена, что приводит к нарушению работы других генов,
в том числе важных для функционирования клеток. В связи с этим полученные клеточные нокауты должны быть охарактеризованы генетически и функционально перед изучением специфических функций целевого гена. Ранее мы показали, что изолирование редактированных клеток в виде поликлональной популяции имеет преимущество перед клонированием по скорости роста и некоторым функциональным показателям. В настоящей работе мы проанализировали функциональные свойства редактированных клеток, полученных методом сортировки с использованием новых маркерных эпитопов, экспрессирующихся на поверхности клетки в контексте GPI-белка CD52 и сравнили их со свойствами клонов, выращенных после обработки CRISPR/Cas9. Функциональность оценивали по репликации ретровирусов человека HIV‑1 и HTLV‑1, сильно зависящей от клеточных факторов репликации.