Организация хлоропластного межгенного спейсера psbA-trnH у двудольных покрытосеменных растений семейства зонтичных (Umbelliferae)статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.
Аннотация:На примере семейства зонтичных изучена организация хлоропластного межгенного спейсера psbAtrnH, который в последнее время приобрел популярность в молекулярнофилогенетических исследованиях на низком таксономическом уровне и в ДНКштрихкодировании. Организация спейсера у зонтичных согласуется с общей схемой, предложенной для покрытосеменных растений. Высокая консервативность области спейсера, прилегающей к гену psbA, обусловлена функциональной нагрузкой, связанной с необходимостью
образования шпильки для поддержания стабильности мРНК после процессинга. Однако только в пределах зонтичных в данной высококонсервативной области происходило удвоение фрагмента, соответствующего петле шпильки, а также независимое возникновение в разных родственных линиях сходных замен, приво
дящих к стабилизации стебля шпильки. 3'Область спейсера, прилегающая к гену trnH, отличается сильной
вариабельностью по длине, вызванной присутствием большого числа делеций в разных группах зонтичных.
Выявленные особенности позволяют использовать спейсер в качестве филогенетического маркера, при этом наиболее информативными оказываются не точечные замены, а вставки/выпадения отдельных фрагментов. Однако высокая консервативность у близкородственных таксонов и наличие гомопластичных инверсий в области шпильки сильно ограничивают возможности использования спейсера как ДНКштрихкода в семействе зонтичных.