|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
INFLUENCE OF MEMBRANE LIPID COMPOSITION AND POINT MUTATIONS ON CONFORMATIONAL EQUILIBRIUM OF Β2-ADRENOCEPTOR: MOLECULAR DYNAMICS STUDYтезисы доклада
- Авторы: Bogdan T.V., Alekseev E.S.
- Сборник: 23 международная конференция МАТЕММАТИКА КОМПЬЮТЕР ОБРАЗОВАНИЕ Биофизика сложных систем. Тезисы
- Серия: Молекулярное моделирование. Системная биология
- Том: 23
- Тезисы
- Год издания: 2016
- Место издания: АНО ИИКИ Москва-Ижевск
- Первая страница: 43
- Последняя страница: 43
- Аннотация: Изменение внешних факторов, к которым относится избыток или недостаток содержания различных компонентов билипидного слоя, может приводить к различным эффектам in vivo. Так, в случае β2-адренорецептора экспериментальные исследования показали [1], что в мембранах, насыщенных холестерином, увеличивается термостабильность рецептора. Также, для аденозинового A2A рецептора в ходе молекулярно-динамического моделирования было показано, что холестерин стабилизирует конформацию внутримембранных спиралей [2], что приводит к изменению активности рецептора. Согласно исследованиям [1, 3] в β2-адренорецепторе и родственных рецепторах присутствует консервативная аминокислотная последовательность, отвечающая за взаимодействие с холестерином. Однако роль отдельных аминокислотных остатков во взаимодействии рецептора с холестерином изучена не была. Выяснить это можно путем проведения точечной мутации данных остатков. В настоящей работе методом классической молекулярной динамики было исследовано влияние состава билипидного слоя (наличие или отсутствие холестерина) на конформационную динамику β2-адренорецептора. Дополнительно нами было исследовано влияние точечной мутации в консервативной аминокислотной последовательности, отвечающей за взаимодействие с холестерином. Моделирование было проведено для β2-адренорецептора в гидратированном липидном бислое на базе суперкомпьютера «Ломоносов» НИВЦ МГУ имени М.В. Ломоносова. Для проведения расчетов использовался программный пакет GROMACS, силовое поле CHARMM36, длина молекулярно-динамических траекторий составляла 700 нс.
- Добавил в систему: Богдан Татьяна Вениаминовна