Новая программа для выявления геометрического ядра набора структур комплексов макромолекулстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.
Аннотация:Сравнительный анализ структур гомологичных белков часто помогает выявить функционально важные
особенности этих структур. Это относится не только к структурам отдельных молекул белка, но и к
структурам макромолекулярных комплексов. В частности, сравнительный анализ структур комплексов
гомологичных белков с ДНК важен для анализа узнавания ДНК белками. В статье описана программа LCore, предназначенная для поиска геометрического ядра семейства структур. Под геометрическим ядром понимается набор аминокислотных и нуклеотидных остатков, сходным образом расположенных во всех структурах семейства. Описан алгоритм программы, веб интерфейс к ней и пример ее применения для сравнительного анализа комплексов гомеодоменов с ДНК.