A New Program for Detecting the Geometrical Core of a Set of Structures of Macromolecular Complexesстатья
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 17 июня 2016 г.
Аннотация:Сравнительный анализ структур гомологичных белков часто помогает выявить функционально важные особенности этих структур. Это относится не только к структурам отдельных молекул белка, но и к структурам макромолекулярных комплексов. В частности, сравнительный анализ структур комплексов гомологичных белков с ДНК важен для анализа узнавания ДНК белками. Мы представляем программу LCore, предназначенную для поиска геометрического ядра семейства структур, то есть набора аминокислотных и нуклеотидных остатков, сходным образом расположенных во всех структурах семейства. Описан алгоритм программы, веб-интерфейс к ней и пример её применения для сравнительного анализа комплексов гомеодоменов с ДНК.