Географические тренды в распространении полиморфных вариантов генов метаболизма и иммунного ответа в популяциях коренных народов Западной Сибиритезисы доклада
Аннотация:В экспедициях (2004-2018 гг.) в регионы Западной Сибири собраны биологические образцы и информационные материалы для исследования генофондов коренных народов данных территорий. Обсуждается фрагмент исследований, включающий изучение популяционных частот и эколого-географических трендов в распространении генов метаболизма этанола (ADH1B* rs1229984, ALDH2* rs671, CYP2E1* rs3813867), белкового, липидного, углеводного обмена (LCT rs4988235, АроЕ ε4 rs769452, AMY2A rs104650, TREH rs2276064, SI rs781470490), витамина D (VDR rs2228570, VDR rs1544410), а также генов хемокиновых рецепторов, влияющих на эффективность работы иммунной системы (CCR2 rs1799864, CCR5 rs333). Суммарный объем выборки обследованных коренных народов составил 1692 человека, из них 1145 человек – коренное население юга Западной Сибири (11 народов Алтае-Саянского нагорья) и 547 человек – представители народов центральной и северной части Западно-Сибирской равнины (7 этнотерриториальных групп тоболо-иртышских сибирских татар и 2 этнотерриториальные группы хантов).
Коренное население Западной Сибири представлено народами, чье развитие до недавнего времени происходило в условиях относительной изоляции под влиянием комплекса природно-климатических и этно-социальных факторов. В исторической ретроспективе несомненный вклад в формирование генетической структуры сибирских популяций вносили особенности образа жизни, включая практикуемые системы жизнеобеспечения, фактор питания, эпидемиологическую обстановку в местах компактного расселения.
Результаты исследования подтверждают высокую генетическую гетерогенность коренных народов Западной Сибири. Выявлены «пики» аллельных частот CCR5 rs333 у горно-таежных шорцев (CCR5*del32 = 0.184), CCR2 rs1799864 у хакасов-сагайцев (CCR2*64I = 0.593) и ряд других. Межпопуляционная подразделенность (GST) варьировала в зависимости от комплекса генов и принципов группировки выборок. По генам биотрансформации этанола GST составила 3,22, а генам белкового, липидного и углеводного обмена оказалась в 3 раза выше – GST = 9,21. Полученные значения генетических расстояний (d) между исследованными народами, в целом, соответствуют территориальным дистанциям. В отношении частот аллелей изученного комплекса генов прослеживаются четкие географические тренды с юго-востока на северо-запад ареала расселения исследованных коренных народов Западной Сибири.
Благодарности: Данная работа была выполнена при поддержке РФФИ проекты № 18-013-00942 и 18-09-00487