|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Филогения и морфология некоторых видов рода Gomphonema Ehrenbergтезисы доклада
- Авторы: Кезля Е.М., Мальцев Е.И., Глущенко А.М., Куликовский М.С.
- Сборник: Вопросы современной альгологии
- Серия: №2 (20)
- Тезисы
- Год издания: 2019
- Первая страница: 181
- Последняя страница: 183
- DOI: 10.33624/2311-0147-2019-2(20)-181-183
- Аннотация: Одним из крупнейших родов в семействе Gomphonemataceae является род Gomphonema Ehrenberg, который характеризуется гетерополярной симметрией, центральным положением шва, наличием поровых полей в нижней части створки. Отличительной особенностью рода являются однорядные штрихи (редко двухрядные), состоящие из пороидов, закрытых с наружной стороны волой, образующей лишь небольшую с-образную щель, либо округлыми пороидами, с наличием внутри них небольших выростов (Куликовский и др., 2016). Стигма часто присутствует. В тоже время именно этот род отличается от других родов семейства очень большим разнообразием. Морфология многих таксонов не является одинаковой. Ранее в этот род включались все таксоны с гетерополярной симметрией. В работе рассматриваются новые данные по морфологическому и молекулярно-генетическому изучению представителей этого рода из водоемов Москвы, Вьетнама, Эфиопии и других регионов. В нашем исследовании изменчивости молекулярных маркеров штрих-кода на примере области V4 SSU проанализировано 48 нуклеотидных последовательностей, представляющих 48 моноклональных штаммов диатомовых водорослей из рода Gomphonema. Все штаммы выделены из достаточно удаленных друг от друга пресноводных экосистем как на территории России (оз. Байкал, Карелия, Алтай), так и за ее пределами (Вьетнам, Индонезия, Монголия и Эфиопия). Также в анализ были включены уже депонированные в GenBank последовательности области V4 SSU таких видов Gomphonema как G. acuminatum (KJ011671), G. affine (HQ912608), G. angustatum (KJ011652), G. brebissonii (KJ011653), G. carolinense (KJ011654), G. dichotomum (KJ011655), G. gracile (KJ011656), G. intricatum (KJ011657), G. parvulum (HQ912595), G. pumilum (KC736629) и G. subclavatum (KJ011666). У исследованных штаммов длина области V4 SSU составила 225–227 п.н. Внутри выравнивания оказалось 53 вариабельных нуклеотидных позиции (23% от всей длины области V4 SSU), при этом последовательности известных видов из GenBank отличались лишь 39 позициях. Не укорененное Байесовское филогенетическое дерево, построенное на основе полученного выравнивания V4 SSU, показало наличие не менее 35 отличающихся филогенетических линий внутри рода Gomphonema, представленных как одним, так и несколькими штаммами. Следует отметить, что близкие штаммы не всегда соответствовали одному географическому региону. Нами обнаружены клады, в которые вошли представители из географически менее отдаленных районов, например, разных островов Индонезии (штаммы ind95, ind96 и ind302), оз. Байкал и Монголии (mnp151 и B351; B691 и mnp78). Также присутствуют клады, представляющие достаточно отдаленные территории: Карелию и Эфиопию (штаммы ka12 и ef10), Карелию и Монголию (mnp105 и ka10), оз. Байкал и Вьетнам (B300 и VN322). В целом, обнаруженные вариабельные позиции внутри области V4 SSU, приводящие к обособлению отдельных филогенетических линий внутри рода Gomphonema, свидетельствуют о том, что выделенные нами новые штаммы могут быть ранее генетически неизученными уже известными видами или представлять новые линии в Gomphonema.
- Добавил в систему: Глущенко Антон Михайлович