|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Изменение протеомного профиля E. coli при удалении генов, кодирующих гистоноподобный белок HU: по данным дифференциального двумерного гель-электрофорезастатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАКСтатья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 28 октября 2020 г.
- Авторы: Камашев Д.Э., Ракитина Т.В., Матюшкина Д.С., Евсютина Д.В., Ванюшкина А.А., Агапова Ю.К., Анисимова В.Е., Дробышев А.Л., Бутенко И.О., Побегуц О.В., Фисунов Г.Ю.
- Журнал: Биоорганическая химия
- Том: 45
- Номер: 5
- Год издания: 2019
- Издательство: Российская академия наук
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 524
- Последняя страница: 533
- DOI: 10.1134/S0132342319050026
- Аннотация: Гистоноподобный белок HU принадлежит к семейству белков, ассоциированных c бактериальным нуклеоидом (nucleoid associated proteins, NAPs) и является наиболее консервативным белком этого семейства. Он неспецифически связывает двуцепочечную ДНК и предпочтительно связывает ДНК,имеющую разрывы и изгибы. Белок HU пределяет архитектуру бактериального нуклеоида; его удаление ведет к потере жизнеспособности бактерий Bacillus subtilis и Mycoplasma genitalium, у которых отсутствуют другие белки семейства NAPs. Влияние белка HU на экспрессию генов известно из транскриптомных исследований, в которых были определены его регулоны. Генетическая делеция белка HU вызывает нарушение регуляции экспрессии генов в E. coli, при этом скорость роста бактерии в стандартных условиях почти не изменяется. Для того, чтобы понять, как бактерия противостоит беспорядочной экспрессии генов, мы предприняли сравнительный протеомный анализ клеток E. coli дикого типа и клеток, нокаутных по генам, кодирующим белок HU. Методом двумерного гель-электрофореза установлено, что в целом белковый профиль следует изменению профиля экспрессии генов. В то же время, обнаружено, что в некоторых случаях уровень экспрессии генов и представленность кодируемых белков меняются разнонаправленно, что указывает на необходимость дополнения транскриптомного анализа результатами протеомных исследований.
- Добавил в систему: Евсютина Дарья Викторовна