Построение модели QSRR на основе теоретически рассчитанных дескрипторов для предсказания времен удерживания энантиомерных молекул в условиях ОФ ВЭЖХ

Федорова, Е.С.; Плющенко, И.В.; Ставрианиди, А.Н.; Шпигун, О.А.; Буряк, А.К.

Авторы: Федорова Е.С., Плющенко И.В., Ставрианиди А.Н., Шпигун О.А., Буряк А.К.
Сборник: АНАЛИТИЧЕСКАЯ ХРОМАТОГРАФИЯ И КАПИЛЛЯРНЫЙ ЭЛЕКТРОФОРЕЗ Материалы IV Всероссийской конференции с международным участием
Тезисы
Год издания: 2020
Место издания: Краснодар
Первая страница: 117
Последняя страница: 117
Аннотация: Для предсказания времен удерживания в ВЭЖХ используются различные модели,например, физико-химическая модель сольватационных параметров Абрахама, модельзависимости структура-удерживание (QSRR), широко применяемая в течение последнегодесятилетия. Использование QSRR позволяет найти закономерность между временемудерживания и структурой вещества в виде математических моделей. Модели QSRR могутбыть получены либо из экспериментально определенных молекулярных дескрипторов, либоиз теоретически рассчитанных молекулярных дескрипторов. Объединенная модель QSRR смасс-спектрометрическими данными может быть использована для идентификациисоединений. Подобная вычислительная модель, способная прогнозировать временаудерживания для любой молекулярной структуры, позволила бы разделять кандидатов саналогичными спектрами, но с разными временами удерживания.В данной работе предложен подход на основе модели QSRR с использованиемкомбинации рассчитанных на основе различных подходов в представлении молекулдескрипторов, а так же теоретических дескрипторов различающихся для энантиомерныхмолекул. Использование дескрипторов, различающихся для оптически изомерных молекул,позволяет предсказывать удерживания для очень близких по структуре молекул. Дляпостроения модели QSRR использовали весь набор данных, без исключения ―неподходящих‖молекул, например, наиболее полярных молекул, элюирующихся в начале хроматограммы.Таким образом, данная модель может быть использована для предсказания удерживаниямолекул, обладающих различной полярностью. Важным этапом в предсказании временудерживания является предобработка данных. В данной работе использовали поиск схожихмолекул из базы данных METLIN, содержащую 80038 молекул и данные по временамудерживания. Поиск структурно схожих молекул проводили на основе ―fingerprints‖,характеризующих структуру молекул. Для полученного набора молекул были рассчитаныописанные выше дескрипторы. Для предсказания времен удерживания использовалиразличные регрессионные модели, наименьшее значение средней абсолютной ошибки инаибольшим значением R2 было получено с применением градиентного бустинга. Дляполученной регрессионной модели средняя абсолютная ошибка составила 37.5 секунд, R2 =0.996.Работа выполнена при частичной финансовой поддержке РФФИ №18-03-00742.
Добавил в систему: Плющенко Иван Викторович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИПМех РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИПМех РАН

Прикрепленные файлы