|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Многомерный статистический анализ пространственных структур ДНК в интерфейсах комплексов гомеодомен-ДНК: «диккерсоновы параметры»статья
- Авторы: Полозов Р.В., Грохлина Т.И., Панченко Л.А., Иванов В.В.
- Сборник: АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ Научный журнал, 2020
- Том: 5
- Год издания: 2020
- Место издания: МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ СЕВАСТОПОЛЬСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ
- Первая страница: 386
- Последняя страница: 389
- Аннотация: Специфические комплексы гомеодоменов с ДНК образуются при связывании белка с двуспиральной ДНК в B-форме (по широкому желобу). Классификация комплексов белок-ДНК и их интерфейсов по физико-химическим, геометрическим параметрам связана с решением ряда задач вычислительного и статистического характера. Классификация должна дать сведения о взаимосвязи комплексов друг с другом, дать возможность проследить их эволюцию и дать основу для формулировок правил узнавания и построения моделей узнавания. Для решения задач классификации необходимо составить список надлежащих дескрипторов комплексов и их интерфейсов, провести многомерный статистический анализ данных из этого списка. Мы используем геометрические параметры, 3DNA: a software package, пространственных структур ДНК в интерфейсах 75 комплексов гомеодомен-ДНК (PDB). В данной работе представлены результаты многомерного статистического анализа «диккерсоновых параметров» пар азотистых оснований ДНК в интерфейсах комплексов гомеодомен-ДНК. Ключевые слова: гомеодомен-ДНК, «диккерсоновы параметры», интерфейс, деформация ДНК, классификация. Процессы ассоциации и диссоциации белков – факторов транскрипции с ДНК - являются основой регуляции транскрипции. Структурные типы факторов транскрипции и их комплексов с ДНК весьма разнообразны и образуют несколько семейств. Одно из них – это семейство гомеодоменов и их комплексов с ДНК.
- Добавил в систему: Панченко Лариса Андреевна