|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Многомерный статистический анализ пространственных структур ДНК в интерфейсах комплексов семейства гомеодомен - ДНК: спиральные параметрыстатья
- Авторы: Полозов Р.В., Грохлина Т.И., Панченко Л.А., Иванов В.В.
- Сборник: Доклады Международной конференции “Математическая биология и биоинформатика”
- Серия: doi: 10.17537/icmbb20.25
- Том: 8
- Год издания: 2020
- Место издания: Пущино: ИМПБ РАН Pushchino: IMPB RAS
- Первая страница: 120
- Последняя страница: 4
- Номер статьи: № e32
- DOI: 10.17537/icmbb20.25
- Аннотация: Изучение строения семейства комплексов гомеодомен – ДНК и классификация комплексов белок-ДНК и их интерфейсов по физико-химическим, геометрическим параметрам связана с решением ряда задач вычислительного и статистического характера. В данной работе представлены результаты анализа спиральных параметров ДНК в интерфейсах 75 комплексов семейства гомеодомен – ДНК. Цель работы – исследовать взаимосвязь комплексов друг с другом, иметь возможность проследить их эволюцию и дать основу для формулировок правил узнавания и построения моделей узнавания. Для анализа данных мы используем методы многомерного статистического анализа: для проверки гипотезы независимости признаков – критерий Спирмена; ANOVA, непараметрического дисперсионного анализа – тест Крускала-Уоллиса, медианный критерий Брауна – Муда, которые показали, что структура комплекса не влияет на геометрические параметры ДНК; методы кластерного и дискриминантного анализа. Кластерный анализ разбил исходную выборку на три однородные группы, класса. Дискриминантный анализ показал, что значения корректных вероятностей классификации больше 75 %. Полученные результаты, возможно, позволят определить в семействе комплексов гомеодомен – ДНК филогенетические связи комплексов (по родству) или по типологии (по сходству).
- Добавил в систему: Панченко Лариса Андреевна