УЛЬТРАЗВУКОВОЕ РАСЩЕПЛЕНИЕ ДНК: АНАЛИЗ СТРУКТУРНО- ДИНАМИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК РЕГУЛЯТОРНЫХ УЧАСТКОВ ГЕНОМА И ОШИБОК СЕКВЕНИРОВАНИЯстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 23 сентября 2021 г.
Аннотация:Приведен краткий обзор одной из сторон многогранной научной деятельности выдающегося ученого-экспериментатора С.Л. Гроховского - открытия им нового физико-химического явления специфичности ультразвукового расщепления межнуклеотидных связей в двухспиральной В-ДНК. Это явление позволило связать эффекты расщепления с конформационно-динамическими характеристиками нуклеотидных последовательностей в В-ДНК и дало возможность проводить биоинформатический анализ геномов на новой основе. Функциональные участки ДНК обладают определенными конформационно-динамическими характеристиками, что позволяет ставить и решать задачи эпигенетики и канцерогенеза.The article is dedicated in memory of Dr. Sergei Lvovich Grokhovsky, a distinguished scientist and an experimenter. This paper contains a brief review of one aspect of the multifaceted scientific activity of Dr. S.L. Grokhovsky whose work contributed immensely to the understanding of a new physicochemical event such as the specificity of ultrasound-induced cleavage of internucleotide bonds in double-stranded B-DNA. His discovery has afforded a view of the cleavage effects within the conformational and dynamic characteristics of nucleotide sequences in B- DNA and an opportunity to conduct bioinformatical analysis of genomes on a new plane. Functional DNA regions are characterized by distinct conformational-dynamic features. We demonstrate the effectiveness of this approach for the analysis of correlation of these conformational and dynamic features with the epigenetic development and carcinogenesis.