|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
The chymotrypsin-like S1 peptidase family of Tenebrionidae beetlesтезисы доклада Тезисы
- Авторы: Zhiganov N., Tereshchenkova V., Salimgareev R., Filippova I., Elpidina E.
- Сборник: FEBS Open Bio
- Серия: Suppl. 1
- Том: 11
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Место издания: Wiley
- Первая страница: 135
- Последняя страница: 136
- Номер статьи: P-01.3-19
- DOI: 10.1002/2211-5463.13205
- Аннотация: Семейство химотрипсина S1 - одно из самых многочисленных семейств пептидаз. Мы изучили и подробно охарактеризовали набор предсказанных S1 сериновых пептидаз (SP) в транскриптомах и геноме двух модельных насекомых Tenebrionidae, Tenebrio molitor и Tribolium castaneum. S1 SP обеспечивает до 60% общей протеолитической активности пищеварительного тракта у T. molitor и до 27% у личинок T. castaneum. Поиск последовательностей SP проводили в транскриптомах РНК-Sec кишечника и целых личинок T. molitor без секвенированного генома, а также в геноме и транскриптоме личиночной кишки T. castaneum. T. molitor SP были вручную аннотированы, а аннотации T. castaneum в GenBank при необходимости были вручную отредактированы. Транскриптом личинок кишечника T. molitor содержал 196 предсказанных последовательностей белков, гомологичных S1 SP, а транскриптом кишечника T. castaneum - 157 последовательностей. Среди них было 97 предсказанных активных ферментов у T. molitor и 102 у T. castaneum, содержащих типичные каталитические остатки. У остальных последовательностей 99 и 55 соответственно отсутствовала консервация в остатках активного сайта, и они были классифицированы как неактивные гомологи SP. Дополнительные 138 последовательностей были обнаружены в транскриптоме целых личинок T. molitor. Наборы SP от обоих насекомых содержали предсказанные последовательности трипсинов, химотрипсин-подобных пептидаз, эластаз, коллагеназ, а 22-26 неаннотированных последовательностей содержали необычные остатки субсайта связывания субстрата S1. Самой многочисленной группой у обоих насекомых были трипсины (34–44 последовательности), а наименьшей - коллагеназы (5–4). Только 8-10 активных SP имели высокий уровень экспрессии мРНК, лишены дополнительных регуляторных доменов и предположительно могут быть связаны с пищеварительными пептидазами. В то же время почти половина трипсинов с низким уровнем экспрессии мРНК содержала регуляторный клип-домен и предположительно принадлежала регуляторному SP. Проведен филогенетический анализ S1 SP.Исследование финансировалось РФФИ, проект № 20-54-56044 Иран_т.
- Добавил в систему: Элпидина Елена Николаевна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | раздел постеров конгресса | posters_2211-5463.13205.pdf | 3,4 МБ | 18 сентября 2021 [Elena_Elpidina] |
| 2. | Полный текст | Тезисы | 2021_Zhiganov_FEBSopenbio.pdf | 186,1 КБ | 2 декабря 2021 [ValeriyaSh] |