АРХИТЕКТУРА НУКЛЕОИДА В ПОКОЯЩИХСЯ КЛЕТКАХ ESCHERICHIA COLIстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 8 апреля 2022 г.
Аннотация:обзоре приведены результаты экспериментальных исследований изучения структуры конденси-рованной ДНК в нуклеоиде покоящихся клеток бактерий Escherichia coli (E. coli), возникающих пристрессе голодания. Конформация ДНК изучалась с помощью дифракции синхротронного излуче-ния и просвечивающей электронной микроскопии. Проведенная впервые серия дифракционныхэкспериментов свидетельствует о наличии периодической упорядоченной организации (скорее всего,нанокристаллической) ДНК с ДНК-ассоциированными белками во всех изученных объектах, под-вергнутых стрессу голодания: бактерии E. coli, споры и бактерии Bacillus Cereus, мицелиальные грибыUmbelopsis ramanniana. Просвечивающая электронная микроскопия позволила извлечь более тонкуювизуальную информацию о типе конденсации ДНК в нуклеоиде бактерии E. coli. В результате исследо-ваний с помощью ПЭМ удалось найти внутриклеточные нанокристаллические, жидкокристаллическиеи свернутые нуклеосомоподобные структуры ДНК. Доля специфической структуры зависит от штаммаи условий культивирования. Свернутая нуклеосомоподобная структура наблюдалась и описана воригинальных исследованиях авторов впервые. Электронно-микроскопические исследования невизуализируют ДНК напрямую, поэтому предполагаемая конформация ДНК является гипотетиче-ской. Для получения четкой картины структуры ДНК во внутриклеточных кристаллах изучены кри-сталлы in vitro с помощью рентгеновской макромолекулярной кристаллографии и электронно-мик-роскопических исследований. Электронно-микроскопические исследования позволили, в отличиеот дифракционных экспериментов, увидеть следы ДНК в тонких (2D) ДНК–Dps кристаллах. Пред-ложена гипотетическая модель конформации ДНК во внутриклеточных нанокристаллах. Приве-денные экспериментальные результаты позволили визуализировать структуры нижнего иерархиче-ского уровня компактизации ДНК в нуклеоиде покоящихся клеток.