Аннотация:РНК-связывающий структурный домен S1, принадлежащий к суперсемейству
олигосахарид/олигонуклеотид-связывающих доменов, широко распространён и консервативен
для прокариот, архей и эукариот. Несмотря на известную склонность к агрегации рибосомных
белков S1, способность к фибриллообразованию у амилоидогенных участков белков S1 мало
изучена. В данной работе мы объединили биоинформатические и экспериментальные подходы
для изучения особенностей амилоидогенных областей в этом семействе белков.
Биоинформатические инструменты были использованы нами для оценки склонности к
образованию фибрилл на примере 1331 последовательности рибосомного белка S1 и для
идентификации таких областей в различных структурных доменах. Мы показали, что доля
амилоидогенных участков для полноразмерных белков снижается с увеличением размера
белков. Внутри отдельных доменов амилоидогенные области чаще предсказываются на N- и Cконцевых участках. Для выбранных нами и синтезированных 11 амилоидогенных пептидов из
рибосомных белков S1 Escherichia coli и Thermus thermophilu