Природные гипотетические олигонуклеотидные модификаторы, регуляторыактивности и теоретические минимальные РНК-кольца, упорядочивающие процессы экспрессии и модификациигенов / генома (DOI: 10.17650/1726‑9784‑2022‑ 21‑1‑21‑32)

Дейчман, А.М.

Автор: Дейчман А.М.
Журнал: Российский биотерапевтический журнал
Том: 20
Номер: 1
Год издания: 2022
Издательство: Изд. группа РОНЦ
Местоположение издательства: М.
Первая страница: 21
Последняя страница: 32
Номер статьи: DOI: 10.17650/1726‑9784‑2022‑ 21‑1‑21‑32
DOI: 10.17650/1726
Аннотация: Специальный гипотетический механизм вариабельной поэпитопной обратной трансляции (по крайней мере 2 типов) отдельного эпитопа эукариотической клетки, вероятно, способен воспроизводить первичные линейные (типа сенс- / антисенс-, CRISPR-, повторподобные и др.) и вторичные конформационные (подобные квадру-плексным, РНК-шпилечным, РНК-кольцевым структурам и др.) олигонуклеотидные структуры. Эти структуры формируются в митохондриальной мембраносвязанной супрамолекулярной и содержащей наномолекулярные включения гипотетической частице ретранслосоме. Это так называемые нуклеиновые эквиваленты (НЭ) бел-кового эпитопа, олиго-НЭ, мономерные в ~15–30 и олигомерные в ~(15–30)n нуклеотидов, потенциально способные участвовать в регуляции экспрессии (активации, терминации, переключении) и модификации генов / ге-нома, а также в создании белок / фермент-содержащих нуклеопротеидных платформа- / модуль- / комплексподобных образований в нормальных и некоторых патологически измененных (в частности, опухолевых) и вирусинфицированных клетках. Недавно в базах GenBank показаны реально и выстроены / рассчитаны биоинформатически in silico минимальные теоретические в ~22 нуклеотида и более длинные РНК-кольцевые (стебель-петлевые)структуры. Их состав зависит от постоянно протекающих химических и ферментативных процессов (в том числе мутаций дезаминирования), а свойства связывают, соответственно, с ранним (эпохи циркулярного кода)и более поздним (эпохи современного универсального кодирования, включающего циркулярный код в качестве составной части) эволюционными периодами становления генетического кода. Принято считать, что с РНК-кольцевыми стебель-петлевыми структурами, схожими с ранее и независимо предложенными олиго-НЭ, связано появление и становление, соответственно, раннеэволюционных (прото-тРНК, прото-рРНК) и современных вариантов молекул-компонентов трансляционной машины митохондрий и цитоплазмы, таких как тРНК, рРНК и мРНК рибосомоассоциированных генов белков.A special hypothetical mechanism of variable Individual Epitope Reverse Translation (at least 2 types) of eukaryotic cell is probably capable of reproducing primary linear (sens- / antisense-, CRISPR-, repeat-like, etc.) and secondary conformational (similar to quadruplexs, RNA-hairpins, RNA-ring-structures; etc.) oligonucleotide structuresformed in the mitochondrial membrane-bound supramolecular and containing nanomolecular inclusions hypothetical particle of the retranslosome. This is the so-called nucleic acid equivalents of protein epitope, oligo-NEs, monomeric in ~15–30 and oligomeric in ~(15–30)n nucleotides, potentially capable of participating in the regulation of expression (activation, termination, switching) and modification of genes / genome, as well as in the creation protein / enzyme-containing nucleoprotein platform- / module- / complex-like formations in normal, pathologically altered (in particular, tumor) and virus-infected cells. Recently, in the GenBank databases, they are shown realisticallyand built / calculated bioinformatically in silico so-called minimum theoretical of 22 nucleotides and longer RNAring (stem-loop) structures, the composition of which depends, firstly, on constantly occurring chemical and enzymatic processes (including deamination mutations), and the properties of which, secondly, link, respectively, with theearly (era of the so-called circular code) and later (era of modern universal coding, including the circular code as a component)evolutionary periods of the formation of the whole genetic code. It is generally accepted that the emergence and formation, respectively, of early evolutionary (proto-tRNA, proto-rRNA) and modern variants of molecules of the translational machine of mitochondria and cytoplasm is associated with stem-loop RNA-ring structures, similar to independently proposed oligo-NEs, such as tRNA, rRNA and gene products of ribosomal and other proteins.
Добавил в систему: Дейчман Александр Маркусович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИПМех РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИПМех РАН

Прикрепленные файлы