Аннотация:Роторная АТФ-синтаза F-типа (F-АТФаза) — один из ключевых ферментов метаболизма. АТФ-синтазы представляютсобой мультисубъединичные комплексы и сопрягают трансмембранный перенос ионов водорода (или натрия) и реакциюсинтеза/гидролиза АТФ. Для биоинформатического изучения разнообразия генов АТФ-синтазы и поиска корреляций между первичной структурой фермента и его функциональными особенностями в нашей лаборатории был выбран набор геномовпрокариот из базы данных кластеров ортологичных генов (COG, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/cog). База данных COG построена на геномах 711 организмов, относительно равномерно покрывающих все филогенетическое разнообразие прокариот (83 архей и 628 бактерий). Субъединица ε бактериальой F-АТФ-синтазы представляет собой небольшой белок из двух доменов – N-концевой бета-бочки, играющей структурную роль, и подвижного α-спирального C-концевого домена, способного изменять конформацию в зависимости от условий. N-концевой домен необходим для сопряжения протонного транспорта, а С-концевой домен способен селективно ингибировать АТФазную активность фермента. У некоторых бактерий субъединица ε сама способна связывать АТФ; при этом стабилизируется конформация, не оказывающая ингибиторного действия на АТФазную активность. В данной работе был проведен биоинформатический анализ многообразия вариантов субъединицы ε бактериальных F-АТФ-синтаз и поиск корреляций между первичной структурой ее регуляторного домена и физиологическими особенностями бактерий.