|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Оценка различных индексов разнообразия для характеристики почвенного прокариотного сообщества по данным метагеномного анализастатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАКДата последнего поиска статьи во внешних источниках: 21 августа 2017 г.
- Авторы: Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Кутовая О.В.
- Журнал: Почвоведение
- Номер: 4
- Год издания: 2015
- Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 462
- Последняя страница: 468
- DOI: 10.7868/S0032180X15040036
- Аннотация: Проведено сравнение применимости используемых в экологии индексов разнообразия для оценки метагеномов прокариотных сообществ почв на разных филогенетических уровнях. Рассмотрены следующие показатели: количество обнаруженных таксонов, индексы Шеннона, Менхиника, Маргалефа, Симпсона, Chao1 и ACE. Анализ разнообразия прокариотных сообществ проводили на примере верхних горизонтов чернозема типичного (Haplic Chernozem (Pachic)), темно-каштановой (Haplic Kastanozem (Chromic)) и крайнеаридной пустынной почв (Endosalic Calcisol (Yermic)) на основе анализа 16S рРНК генов. Индексы Менхиника, Маргалефа, Chao1 и ACE демонстрировали сходные результаты по разделению сообществ по уровню разнообразия, индекс Симпсона давал хорошие результаты только при анализе таксонов высокого уровня (филумов), наилучшие результаты показал индекс Шеннона. В целом все использованные индексы показывали уменьшение разнообразия в ряду черноземтемно-каштановаякрайнеаридная пустынная почва.
- Добавил в систему: Чернов Тимофей Иванович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Statya_indeksyi_-_ottisk.pdf | 339,6 КБ | 5 апреля 2017 [chern-off] |