|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Визуализация результатов анализа структуры метилирования ДНК как инструмент контроля качества молекулярной классификации опухолей ЦНСстатья
- Авторы: Петрова Е.И., Галстян С.А., Телышева Е.Н., Рыжова М.В.
- Журнал: Российский нейрохирургический журнал имени профессора А.Л. Поленова
- Том: 14
- Номер: 4
- Год издания: 2022
- Издательство: ООО "Семинары, Конференции и Форумы"
- Местоположение издательства: Санкт-Петербург
- Первая страница: 64
- Последняя страница: 70
- DOI: 10.56618/20712693_2022_14_4_64
- Аннотация: Ввиду высокой значимости оценки структуры метилирования генома для достоверного определения классов опухолей ДНС, анализ ДНК с использованием специальных микрочипов постепенно входит в рутинную практику патоморфологической диагностики. Согласно новой версии классификации опухолей ДНС ВОЗ (5-е издание), в морфологический диагноз рекомендовано включать результаты молекулярно-генетических исследований и учитывать современные представления о профилях метилирования ДНК, характерных для различных классов опухолей. Для интерпретации данных метилирования ДНК, извлекаемых из биопсийного материала, созданы автоматизированные платформы-классификаторы опухолей на основе алгоритмов машинного обучения. Будучи полезными во многих случаях, эти классификаторы также имеют ограничения и не всегда выдают заключение о метиляционном классе опухоли из-за гетерогенности образца или отсутствия похожих образцов в контрольной группе. Преодолеть эти ограничения можно, внедряя дополнительные графические методы анализа биологических данных, позволяющие отслеживать сходство между метиляционными профилями опухолей и свидетельствовать в пользу определённого диагноза. В данной работе мы демонстрируем разработанный нами интерактивный инструмент для визуализации данных метилирования ДНК, дающий возможность отобразить степень сходства и распределение по группам для всех образцов опухолей ДНС, имеющихся в нашей базе данных (n=470), а также сопоставлять гистологические заключения с молекулярными классами. Описанный подход может послужить дополнительным источником информации в работе врача-морфолога и призван повысить качество диагностики в тех случаях, когда иные методы дают неполную или противоречивую картину.
- Добавил в систему: Галстян Сюзанна Андраниковна