Генетическое разнообразие псевдомонад, ассоциированных с зерновыми культурами, пораженными базальным бактериозомстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.
Аннотация:Изучены генетические свойства 45 штаммов псевдомонад, выделенных из зерновых культур с симптомами базального бактериоза. ДНК-фингерпринты, полученные при амплификации с REP-, ERIC-и ВОХ-праймерами, показали значительное генетическое разнообразие штаммов. Рестриктный анализ 16S-23S внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS 1) позволил разделить изученные штаммы на две основные группы. На филогенетическом дереве ITS1 из этих групп вошли в состав двух кластеров, включающих также ITS1 Pseudomonas syringae ('Syringae' кластер) и P. fluoresceins, P. tolaasii, P. reactans, P. gingeri и P. agarici ('Fluorescens' кластер) из базы данных GenBank. Сравнение уровней дивергенции ITS1 в кластере 'Fluorescens' позволило предложить рассмотрение P. tolaasii, P. reactans, а также различных групп P. fluorescens и, возможно, P. gingeri и P. agarici как подвидов одного геномовида. У некоторых из изученных штаммов псевдомонад обнаружена внутриге-номная гетерогенность ITS1. Данные амплификации на специфических праймерах и результаты секвенирования указывают на возможность наличия у изученных штаммов функционально активного гена syrB, участвующего в биосинтезе сирингомицина.