Порядок митохондриальных генов как дополнительный маркер в филогенетических исследованиях насекомыхстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 14 сентября 2017 г.
Аннотация:За миллионы лет эволюции геномы современных насекомых накопили
значительное количество мутаций. Геномные различия некоторых
представителей класса Insecta, принадлежащих одному семейству
или отряду, настолько велики, что могут завести в тупик
при проведении филогенетических исследований и требуют
использования нетрадиционных методов анализа. Известно, что
молекулярная эволюция идет не только путем единичных нуклеотидных
замен, но и включает в себя более крупные геномные перестройки,
такие как изменение порядка генов. Гены митохондриальной
ДНК (мтДНК) достаточно часто используются в качестве
маркера для филогенетических исследований у многих организмов,
в том числе членистоногих, поскольку мтДНК многокопийна,
наследуется по материнской линии, не подвержена рекомбинации
и достаточно быстро (относительно ядерного генома) накапливает
мутации. К настоящему времени в общедоступных базах данных
собрано большое количество полных нуклеотидных последовательностей
митогеномов (тысячи организмов), однако их филогенетический
анализ имеет свои сложности, особенно для представителей
класса Насекомые (Insecta), чья эволюция занимает
значительный
отрезок геологического времени. Целью данного
исследования
была оценка возможности использования новых
методических
приемов филогенетического анализа насекомых.
Сравниваются
два способа филогенетического анализа. Первый
метод использует изменчивость нуклеотидной последовательности
мтДНК, второй – порядок генов в полных митохондриальных
геномах как дополнительный маркер. Показано, что порядок
генов может быть применен в качестве дополнительного маркера
при филогенетических исследованиях представителей отряда
Hymenoptera. Разработана программа mitoSpider, с помощью которой
выявлены 63 последовательности митогеномов насекомых,
где количества генов отличаются от стандартного (для высокоорганизованных
Metazoa).