|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Решение вопросов систематики, филогении и филогеографии в роде Lotus L. (Fabaceae) с использованием секвенирования по Сэнгеру старых гербарных образцовтезисы доклада
- Авторы: Крамина Т.Е., Дегтярева Г.В.
- Сборник: Коллекции как основа изучения генетических ресурсов растений и грибов: Тезисы докладов Второй всероссийской конференции, посвящённой 200-летию указа об именовании Ботанического сада на Аптекарском острове Императорским. Санкт-Петербург, 26–27 июня 2023
- Тезисы
- Год издания: 2023
- Место издания: Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН Санкт-Петербург
- Первая страница: 26
- Последняя страница: 26
- Аннотация: Старые гербарные коллекции являются бесценным источником информации для морфологических и молекулярно-генетических исследований. При хорошей сохранности образцов возможно выделение достаточно качественной ДНК с последующим секвенированием как коротких, так и более длинных участков.Секвенирование участков ядерной (ITS1-5.8S-ITS2 и 5’ETS) и пластидной (trnL-F) ДНК у двух типовых образцов Lotus carpetanus Lacaita из Музея Естественной Истории (BM) сбора 1923 и 1925 гг. позволило подтвердить гипотезу о видах-двойниках в роде Lotus: L. glareosus Boiss. & Reuter и L. carpetanus, ранее считавшихся одним видом. Исследование показало достаточно давнюю дивергенцию этих двух таксонов (p-дистанция между ними составила 0,07– 0,08 по ITS, 0,060 – 0,067 по ETS и 0,010 – 0,013 по trnL-F) (Kramina et al., 2020).Единственной до недавнего времени не изученной молекулярными методами секцией рода Lotus была монотипная секция Benedictella Kramina et D.D. Sokoloff с видом L. benoistii (Maire) Lassen, представляющим морфологически обособленный таксон с неизвестными родственными связями. Это локальный эндемик Марокко, имеющий в IUCN Red List статус вида, находящегося на грани исчезновения. Последние наблюдения вида датированы 90-ми годами XX в., а доступный гербарий – 1934-1936 гг. Образцы имеют плохую сохранность. Применение различных методов выделения ДНК и программ ПЦР позволило получить для образца L. benoistii последовательности ядерной (nrITS) и пластидной (psbA-trnH) ДНК. В филогенетических реконструкциях с включением репрезентативной выборки всех секций рода Lotus и образцов L. benoistii показано, что этот вид относится к северной эволюционной ветви рода, группируясь в общую кладу с секциями Lotus, Dorycnium и Bonjeanea, при этом образуя одну из базальных ветвей северной ветви (неопубликованные данные). Одним из наиболее старых гербарных материалов, по которым нам удалось получить качественные последовательности ядерного nrITS и пластидных (trnL-F и rps16) участков ДНК, были образцы Lotus strictus Fisch. & C.A.Mey. из Болгарии, сборы которых датированы 1893-1896 гг. (гербарий SO). Проведенный анализ образцов этого вида из Турции, Болгарии, Казахстана и южной Сибири показал, что болгарские образцы филогеографически близки к турецким, а по пластидным данным все изученные болгарские (кроме одного) и турецкие образцы представляют общий гаплотип, наиболее близкий к гипотетическому предковому варианту, а сибирско-казахстанская группа носит производный характер (Kramina et al., 2021). Исследования по Lotus benoistii выполнены при поддержке гранта РНФ (проект № 23-24-00052).
- Добавил в систему: Крамина Татьяна Евгеньевна