|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Поиск и аннотация цистеиновых катепсинов в новосеквенированном геноме Tribolium madens и их сравнение с гомологами из Tribolium castaneumтезисы доклада Тезисы
- Авторы: Иванов М.М., Терещенкова В.Ф., Жиганов Н.И.
- Сборник: Материалы Международного молодежного научного форума «Ломоносов-2023»
- Редакторы: Алешковский Иван Андреевич, Андриянов Андрей Владимирович, Антипов Евгений Александрович, Зимакова Екатерина Игоревна
- Серия: География
- Тезисы
- Год издания: 2023
- Издательство: ООО "МАКС Пресс"
- Местоположение издательства: Москва
- Номер статьи: uid806027
- Аннотация: Хрущаки - жуки-вредители из родов Tenebrio и Tribolium семейства чернотелок (TenebrionidaДанные насекомые встречаются повсеместно, обитают в складах и домах в муке, хлебопродуктах, кукурузе, бобовых, что приводит к порче продуктов. Семейство чернотелокявляется объектом многочисленных исследований. Так, геном Tribolium castaneum былсеквенирован первым среди жуков. К числу важнейших пищеварительных ферментовчернотелок относятся цистеиновые и сериновые пептидазы. Они отличаются многообразием и разнообразием, предположительно имеют ряд отличий от пептидаз млекопитающих и слабо изучены. Среди пищеварительных пептидаз изученных видов чернотелок,главная роль принадлежит цистеиновым катепсинам семейства С1 папаина. ИсследованияTenebrio molitor и Tribolium castaneum свидетельствуют о имеющихся различиях в организации их пищеварительного протеолиза, несмотря на принадлежность к одному семействужуков и сходство способов питания. Для того, чтобы оценить масштаб межвидовых различий в организации пищеварения у чернотелок, представляет научный интерес анализнабора цистеиновых катепсинов в новосеквенированном геноме другого вида Tribolium -T. madens, и сравнение его с имеющимися данными у изученных видов T. castaneum иT. molitor.Целью данной работы являлся поиск последовательностей цистеиновых катепсинов вгеноме T. madens и сравнение их с известными последовательностями из T. castaneum иT. molitor.С помощью программы Apollo, используя алгоритм BLAT, был проведен поиск последовательностей катепсинов K, O, L и B в геноме T. madens, схожих с таковыми умодельного насекомого T. castaneum. Всего было получено 16 последовательностей близких к катепсину L, 8 близких к катепсину B, и по одной последовательности близкой ккатепсинам K и O. После поиска похожих последовательностей с помощью blastp большинство найденных белков оказались близки к таковым у T. castaneum. Затем для данных последовательностей было получено множественное выравнивание с гомологами изT. castaneum, отмечены ортологичные последовательности и выделены аминокислотныеостатки их активных центров и субсайтов связывания S1 и S2. На основании множественного выравнивания с охарактеризованными цистеиновыми пептидазами T. castaneum иT. molitor найдены предположительно пищеварительные пептидазы, а на основе широкого сравнения с участием катепсинов млекопитающих выявлены высоко консервативныеортологичные лизосомальные катепсины.Исследование выполнено за счет гранта Российского фонда фундаментальных исследований № 20-54-56044 Иран_т.Выражаю благодарность научному руководителю к.б.н., с.н.с. Е.Н. Элпидиной и д.х.н.,проф. И.Ю. Филипповой.
- Добавил в систему: Терещенкова Валерия Феликсовна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Тезисы | 2023_Ivanov_Lomonosov.pdf | 2,8 МБ | 23 августа 2023 [ValeriyaSh] |