Аннотация:Фермент репарации тирозил-ДНК-фосфодиэстераза 1 (Tdp1) является потенциальной молеку-
лярной мишенью для противоопухолевой терапии. С использованием методов квантовой и молекуляр-
ной механики создана модель Tdp1 человека, учитывающая ионизационные состояния аминокислотных
остатков активного центра и их взаимодействие с субстратом и конкурентными ингибиторами. В активном центре фермента идентифицированы полости, обеспечивающие связывание олигонуклеотида и фосфотирозина и представляющие интерес для дизайна ингибиторов. При помощи разработанной молекулярной модели обнаружены новые ингибиторы Tdp1, сульфогруппа которых способна занимать положение 3’-фосфатной группы субстрата с образованием водородных связей с Lys265, Lys495 и другими аминокислотными остатками участка связывания фосфотирозина.