ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ ВИРИОНА А-ВИРУСА КАРТОФЕЛЯ ПРИ ОГРАНИЧЕННОМ ПРОТЕОЛИЗЕ in situ ПО ДАННЫМ ТРИТИЕВОГО МЕЧЕНИЯ И КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ

Ксенофонтов, А.Л.; Баратова, Л.А.; Семенюк, П.И.; Федорова, Н.В.; Бадун, Г.А.

Авторы: Ксенофонтов А.Л., Баратова Л.А., Семенюк П.И., Федорова Н.В., Бадун Г.А.
Журнал: Биохимия
Том: 88
Номер: 12
Год издания: 2023
Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
Местоположение издательства: Москва
Первая страница: 2541
Последняя страница: 2552
DOI: 10.31857/S0320972523120151
Аннотация: Белки оболочки (БО) вирионов потивируса А-вируса картофеля (АВК) содержат на поверхностичастично неупорядоченные N-концевые домены, необходимые для выполнения жизненно важныхфункций вируса. В данной работе на основе данных, полученных методом тритиевой планигра-фии, проведён сравнительный анализ структур БО в интактных вирионах АВК и в частицах вируса,лишённых N-концевых 32 аминокислот (АВКΔ32). С использованием структуры атомного раз-решения БО потивируса Y картофеля (YBK), который является гомологом АВК, проведён расчётдоступной поверхности белков вириона YВК и определены области межсубъединичных/межвит-ковых контактов. Для этого использовали подход, основанный на обкатке сферической пробойповерхности белка, доступной растворителю (Lee, B., and Richards, F. M. (1971) J. Mol. Biol., 55,379-400). Сравнение профилей включения тритиевой метки в интактный и частично деградиро-ванный вирион АВКΔ32 выявило положение ΔN-пептида, экранирующего остатки 66−73, 141−146и входящие в межвитковую область остатки 161−175. Было обнаружено наличие каналов/полостейв белковой оболочке вириона, благодаря которым он оказался частично проницаемым для атомовтрития. При удалении ΔN-пептида наблюдалось уменьшение содержания метки внутри вириона(в области а.о. 184−200), что указывало на возможный структурный переход, приводящий к ком-пактизации вириона и вследствие этого меньшей доступности для трития его внутренних регио-нов. На основании полученных данных можно сделать вывод, что часть поверхностного ΔN-пеп-тида расположена между витками спирали вириона, это увеличивает шаг спирали и обеспечиваетбольшую гибкость вириону, что важно для межклеточного транспорта вирусов в растениях.
Добавил в систему: Ксенофонтов Александр Леонидович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИПМех РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИПМех РАН

ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ ВИРИОНА А-ВИРУСА КАРТОФЕЛЯ ПРИ ОГРАНИЧЕННОМ ПРОТЕОЛИЗЕ in situ ПО ДАННЫМ ТРИТИЕВОГО МЕЧЕНИЯ И КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯстатья

Прикрепленные файлы