Изучение полиморфизма ампликонов ITS1 и ITS2 ядерной рибосомной ДНК с помощью высокопроизводительного параллельного секвенирования и прямого секвенирования по Сэнгеру у Paeonia lactiflora (Paeoniaceae)статья
Место издания:Издательство Алтайского государственного университета Барнаул
Первая страница:246
Последняя страница:249
Аннотация:Ядерные гены рибосомной РНК (рДНК) представлены тандемно расположенными и многократно повторенными копиями, подвергающимися периодической гомогенизации. Неоднородность кластера рДНК часто считается свидетельством недавних событий гибридизации. В работе изучен внутригеномный полиморфизм внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS1 и ITS2) рДНК у вида Paeonia lactiflora. С помощью метода высокопроизводительного секвенирования подтверждено существование полиморфных позиций, обнаруживаемых при прямом секвенировании по Сэнгеру, а также выявлено несколько дополнительных. В целом показано наличие 27 (9 в ITS1 и 18 в ITS2) полиморфных позиций, представляющих собой как однонуклеотидные замены, так и индели. В большинстве случаев полиморфизм обусловлен появлением нуклеотидов, не отмеченных у других видов, и не вызван гибридным происхождением. По-видимому, несмотря на то, что вид Paeonia lactiflora морфологически хорошо обособлен, на уровне нуклеотидных последовательностей границы вида находятся на стадии оформления. В роде Paeonia полиморфизм ITS может быть следствием не только гибридизации, но и генетической дифференциации.