Аннотация:Структура хроматина и доступность ДНК для белков зависят от структуры “линкер-
ной” ДНК, расположенной на входе в нуклеосому и выходе из неё. Поскольку ДНК яв-
ляется отрицательно заряженным полимером, конформация линкерной ДНК, в свою
очередь, зависит от ионного микроокружения. В настоящей работе методом флуорес-
центной микроскопии одиночных комплексов исследовано влияние ионов Na+ и K+ на
структуру линкерной ДНК мононуклеосом. Выявлено, что нуклеосомы находятся в од-
ном из двух конформационных состояний, заселённость которых существенно меняется
после замены ионов K+ на Na+. Эти изменения, вероятно, обусловлены различным взаи-
модействием Na+ и K+ с ДНК в областях входа ДНК в нуклеосому и выхода из неё. Ка-
тион-зависимые изменения конформации линкерной ДНК могут менять топологические
барьеры в нуклеосоме, структуру полинуклеосомного хроматина и влиять на взаимодей-
ствия с различными белковыми факторами.