Аннотация:Рассмотрены изменения микробоценоза (численности бактерий и биомассы микоризных микромицетов) в ризосферной зоне кукурузы, которая длительно возделывалась на черноземе в монокультуре и в севообороте при применении минеральных удобрений. Для диагностики микроорганизмов использовали молекулярный метод газовой хроматографии – масс-спектро-метрии по биомаркерам – жирно-кислотному составу мембранных структур клеток. Показано, что в контрольном варианте (без применения удобрений) численность бактерий и биомасса микоризных грибов в ризосферной зоне кукурузы была выше в осенний период по сравнению с весенним, как в монокультуре, так и в севообороте. В вариантах с внесением N60 увеличение количества бактерий в ризосферной зоне кукурузы в осенний период наблюдалось в благоприятный по погодным условиям год, а биомассы микоризных грибов – как при благоприятных условиях, так и при засухе.