Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 22 февраля 2019 г.
Аннотация:При комплексном использовании методов молекулярного моделирования и статистической обработки данных проведен анализ спектра конформационных состояний олигосахаридных фрагментов гликановых рецепторов человека LSTa (α-D-Neu5Ac-(2-3)-β-D-Gal-(1-3)-β-D-GlcNAc-(1-3)-β-D-Gal(1-4)-D-Glc) и LSTc(α-D-Neu5Ac-(2-6)-β-D-Gal-(1-3)-β-D-GlcNAc-(1-3)-β-D-Gal(1-4)-D-Glc) в водном растворе, определены основные, а также минорные структуры и выделены наиболее значимые топологии. Для кольца сиалового остатка каждого из пентасахаридов построена и проанализирована поверхность свободной энергии конформационных переходов, определен перечень наиболее вероятных в растворе искаженных структур, отличных от основного состояния лодки 1С4. Полученные результаты хорошо согласуются с данными экспериментального изучения с использованием спектроскопии ядерного магнитного резонанса и рентгеноструктурной кристаллографии.