ИСТИНА

Nolde D.E.

Соавторы: Ефремов Р.Г., Чугунов А.О., Krylov N., Krylov N.A., Арсеньев А.С., Кирпичников М.П., Панина И.С., Borshevsky V.I., Chesnokov Y.M., Efremov R.G., Kamyshinsky R.A., Kocharovskaya M.V., Mishin A.V. показать полностью..., Palmer R., Pentkovski V.M., Polyansky A.A., Pyrkova D.V., Reibarkh M.Y., Schulga A.A., Shenkarev Z.O., Tarasova N.K., Vereshaga Y.A., Volynsky P.E., Volynsky P.E., Yablokov E., Zaigraev M.M., Алифер Е.О., Балеева Н.С., Баранов М.С., Бычков М.Е., Гавриков А.С., Гончарук М.В., Гончарук С.А., Дворякова Е.А., Захарова Г.С., Кульбацкий Д.С., Люкманова Е.Н., Минеев К.С., Мишин А.С., Парамонов А.С., Сосорев А.Ю., Терещенкова В.Ф., Тоневицкий А.Г., Филиппова И.Ю., Шулепко М.А., Элпидина Е.Н.

10 статей, 2 доклада на конференциях, 1 тезисы доклада

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 47, Scopus: 36

IstinaResearcherID (IRID): 2214164

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2022 A Uniquely Stable Trimeric Model of SARS-CoV-2 Spike Transmembrane Domain
    • Aliper Elena T., Krylov Nikolay A., Nolde Dmitry E., Polyansky Anton A., Efremov Roman G.
    • в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 16 DOI
  • • 2022 Membrane-mediated interaction of non-conventional snake three-finger toxins with nicotinic acetylcholine receptors
    • Shenkarev Zakhar O., Chesnokov Yuri M., Zaigraev Maxim M., Chugunov Anton O., Kulbatskii Dmitrii S., Kocharovskaya Milita V., Paramonov Alexander S., Bychkov Maxim L., Shulepko Mikhail A., Nolde Dmitry E., Kamyshinsky Roman A., Yablokov Evgeniy O., Ivanov Alexey S., Kirpichnikov Mikhail P., Lyukmanova Ekaterina N.
    • в журнале Communications Biology, издательство Springer Nature (Switzerland), том 5, № 1 DOI
  • • 2022 Structure-based rational design of an enhanced fluorogen-activating protein for fluorogens based on GFP chromophore
    • Goncharuk Marina V., Baleeva Nadezhda S., Nolde Dmitry E., Gavrikov Alexey S., Mishin Alexey V., Mishin Alexander S., Sosorev Andrey Y., Arseniev Alexander S., Goncharuk Sergey A., Borshchevskiy Valentin I., Efremov Roman G., Mineev Konstantin S., Baranov Mikhail S.
    • в журнале Communications Biology, издательство Springer Nature (Switzerland), том 5, № 1 DOI
  • • 2020 Environmental and dynamic effects explain how nisin captures membrane-bound lipid II
    • Panina Irina, Krylov Nikolay, Nolde Dmitry, Efremov Roman, Chugunov Anton
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 10, № 1
  • • 2020 Environmental and dynamic effects explain how nisin captures membrane-bound lipid II
    • Panina Irina, Krylov Nikolay, Nolde Dmitry, Efremov Roman, Chugunov Anton
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 10, № 1 DOI
  • 
    • 2019 Specific refolding pathway of viscumin A chain in membrane-like medium reveals a possible mechanism of toxin entry into cell
    • Volynsky P.E., Nolde D.E., Zakharova G.S., Palmer R.A., Tonevitsky A.G., Efremov R.G.
    • в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 9, с. 413 DOI
  • 
    • 2012 Dynamic clustering of lipids in hydrated two-component membranes: results of computer modeling and putative biological impact. [Epub ahead of print]. DOI
    • Pyrkova D.V., Tarasova N.K., Krylov N.A., Nolde D.E., Pentkovsky V.M., Efremov R.G.
    • в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 18, с. 10-20
  • 
    • 2007 Specificity of helix packing in transmembrane dimer of the cell death factor BNIP3: a molecular modeling study
    • Vereshaga Ya A., Volynsky P.E., Pustovalova Ju E., Nolde D.E., Arseniev A.S., Efremov R.G.
    • в журнале Proteins: Structure, Function and Bioinformatics, издательство Wiley-Liss Inc (United States), том 69, № 2, с. 309-325
  • 
    • 2007 The membrane-proximal fusion domain of HIV-1 GP41 reveals sequence-specific and fine-tuning mechanism of membrane binding
    • Efremov R.G., Volynsky P.E., Nolde D.E., Vergoten G., Arseniev A.S.
    • в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 25, № 2, с. 195-206
  • 
    • 1998 Three-dimensional structure of binase in solution
    • Reibarkh M.Ya, Nolde D.E., Vasilieva L.I., Bocharov E.V., Schulga A.A., Kirpichnikov M.P., Arseniev A.S.
    • в журнале FEBS Letters, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 431, № 2, с. 250-254

• Доклады на конференциях

  • • 2018 Fighting celiac disease: improvement of pH-stability of Cathepsin L by computational design (Устный)
    • Авторы: Chugunov A., Nolde D., Tereshchenkova V.F., Efremov R., Filippova I.Yu, Elpidina E.N., Dvoryakova E.A.
    • 3rd International Symposium “Mathematical Modeling and High-Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018 / BGRS’2018), Новосибирск, Россия, 21-24 августа 2018
  • • 1998 Spatial structure of binase in water solution.
    • Авторы: Reibarkh M.Ya, Nolde D.E., Bocharov E.V., Kirpichnikov M.P., Vasilieva L.I., Arseniev A.S., Schulga A.A.
    • International Symposium “Protein structure, stability and folding. Fundamental and medical aspects”, Moscow, Russia , Россия, 1998

• Тезисы докладов

  • 
    • 2018 Fighting celiac disease: improvement of pH-stability of Cathepsin L by computational design
    • Chugunov A., Nolde D., Tereshchenkova V.F., Dvoryakova E.A., Filippova I.Yu, Elpidina E.N., Efremov R.
    • в сборнике Proceedings of the 3rd International Symposium “Mathematical Modeling and High-Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018 / BGRS’2018), Novosibirsk, Russia, August 21–24, место издания ФГУП «Издательство СО РАН» Новосибирск, Россия, тезисы, с. 17-17 DOI