Makeev V.
Количество цитирований статей в журналах по данным
Web of Science: 2082,
Scopus: 2036
IstinaResearcherID (IRID): 277323
Деятельность
Статьи в журналах
2021
Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome
Abramov Sergey ,
Boytsov Alexandr ,
Bykova Daria ,
Penzar Dmitry D. ,
Yevshin Ivan ,
Kolmykov Semyon K. ,
Fridman Marina V. ,
Favorov Alexander V. ,
Vorontsov Ilya E. ,
Baulin Eugene ,
Kolpakov Fedor ,
Makeev Vsevolod J. ,
Kulakovskiy Ivan V.
в журнале Nature communications , издательство Nature Pub. Group (United Kingdom) , том 12, № 1
DOI
2020
Insights gained from a comprehensive all-against-all transcription factor binding motif benchmarking study
Ambrosini Giovanna ,
Vorontsov Ilya ,
Penzar Dmitry ,
Groux Romain ,
Fornes Oriol ,
Nikolaeva Daria D. ,
Ballester Benoit ,
Grau Jan ,
Grosse Ivo ,
Makeev Vsevolod ,
Kulakovskiy Ivan ,
Bucher Philipp
в журнале Genome Biology , издательство BioMed Central (London) , том 21, № 1
DOI
2020
Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome
Abramov Sergey ,
Boytsov Alexandr ,
Bykova Dariia ,
Penzar Dmitry D. ,
Yevshin Ivan ,
Kolmykov Semyon K. ,
Fridman Marina V. ,
Favorov Alexander V. ,
Vorontsov Ilya E. ,
Baulin Eugene ,
Kolpakov Fedor ,
Makeev Vsevolod J. ,
Kulakovskiy Ivan V.
в журнале bioRxiv (The preprint server for biology)
DOI
2019
What Do Neighbors Tell About You: The Local Context of Cis-Regulatory Modules Complicates Prediction of Regulatory Variants
Penzar Dmitry D. ,
Zinkevich Arsenii O. ,
Vorontsov Ilya E. ,
Sitnik Vasily V. ,
Favorov Alexander V. ,
Makeev Vsevolod J. ,
Kulakovskiy Ivan V.
в журнале Frontiers in genetics , издательство Frontiers Research Foundation. (Lausanne, Switzerland) , том 10, с. 1078
DOI
2017
An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse
de Rie Derek ,
Abugessaisa Imad ,
Alam Tanvir ,
Arner Erik ,
Arner Peter ,
Ashoor Haitham ,
Åström Gaby ,
Babina Magda ,
Bertin Nicolas ,
Maxwell Burroughs A. ,
Carlisle Ailsa J. ,
Daub Carsten O. ,
Detmar Michael ,
Deviatiiarov Ruslan ,
Fort Alexandre ,
Gebhard Claudia ,
Goldowitz Daniel ,
Guhl Sven ,
Ha Thomas J. ,
Harshbarger Jayson ,
Hasegawa Akira ,
Hashimoto Kosuke ,
Herlyn Meenhard ,
Heutink Peter ,
Hitchens Kelly J. ,
Hon Chung Chau ,
Huang Edward ,
Ishizu Yuri ,
Kai Chieko ,
Kasukawa Takeya ,
Klinken Peter ,
Lassmann Timo ,
Lecellier Charles-Henri ,
Lee Weonju ,
Lizio Marina ,
Makeev Vsevolod ,
Mathelier Anthony ,
Medvedeva Yulia A. ,
Mejhert Niklas ,
Mungall Christopher J. ,
Noma Shohei ,
Ohshima Mitsuhiro ,
Okada-Hatakeyama Mariko ,
Persson Helena ,
Rizzu Patrizia ,
Roudnicky Filip ,
Sætrom Pål ,
Sato Hiroki ,
Severin Jessica ,
Shin Jay W. ,
Swoboda Rolf K. ,
Tarui Hiroshi ,
Toyoda Hiroo ,
Vitting-Seerup Kristoffer ,
Winteringham Louise ,
Yamaguchi Yoko ,
Yasuzawa Kayoko ,
Yoneda Misako ,
Yumoto Noriko ,
Zabierowski Susan ,
Zhang Peter G. ,
Wells Christine A. ,
Summers Kim M. ,
Kawaji Hideya ,
Sandelin Albin ,
Rehli Michael ,
Hayashizaki Yoshihide ,
Carninci Piero ,
Forrest Alistair R.R. ,
de Hoon Michiel J.L.
в журнале Nature Biotechnology , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 35, № 9, с. 872-878
DOI
2017
The complete genome of the oil emulsifying strain Thalassolituus oleivorans K-188 from the Barents Sea
Shtratnikova Victoria ,
Belalov Ilya ,
Kasianov Artem ,
Schelkunov Mikhail ,
Logacheva Maria ,
Novikov Andrey,
Shatalov Alexey,
Gerasimova Tatyana,
Yanenko Alexandr,
Makeev Vsevolod
в журнале Marine Genomics , издательство Elsevier BV (Netherlands)
DOI
2017
The single nucleotide variant rs12722489 determines differential estrogen receptor binding and enhancer properties of an IL2RA intronic region
Afanasyeva Marina A. ,
Putlyaeva Lidia V. ,
Demin Denis E. ,
Kulakovskiy Ivan V. ,
Vorontsov Ilya E. ,
Fridman Marina V. ,
Makeev Vsevolod J. ,
Kuprash Dmitry V. ,
Schwartz Anton M.
в журнале PLoS ONE , издательство Public Library of Science (United States) , том 12, № 2, с. 0172681
DOI
2017
Секвенирование и анализ полного генома нефтеразлагающего штамма Thalassolituus oleivorans K-188
Штратникова В.Ю. ,
Белалов И.Ш. ,
Касьянов А.С. ,
Щелкунов М.И. ,
Логачёва М.Д. ,
Новиков А.Д.,
Шаталов А.А.,
Герасимова Т.В.,
Яненко А.С.,
Макеев В.Ю.
в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия) , издательство Парк-медиа (М.) , том 9, № 1, с. 53-53
2014
Upstream open reading frames regulate translation of the long isoform of SLAMF1 mRNA that encodes costimulatory receptor CD150
Putlyaeva LV ,
Schwartz AM ,
Korneev KV ,
Covic M. ,
Uroshlev L.A. ,
Makeev V.Yu ,
Dmitriev S.E. ,
Kuprash D.V.
в журнале Biochemistry (Moscow) , издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom) , том 79, № 12, с. 1405-1411
DOI
2012
Exploring massive, genome scale datasets with the GenometriCorr package
Favorov A. ,
Mularoni L. ,
Cope LM ,
Medvedeva Y. ,
Mironov AA ,
Makeev VJ ,
Wheelan SJ
в журнале PLoS Computational Biology , издательство Public Library of Science (United States) , том 8, № 5, с. e1002529
DOI
2011
De novo sequencing and characterization of floral transcriptome in two species of buckwheat (Fagopyrum)
Logacheva M. ,
Kasianov A. ,
Vinogradov D. ,
Samigullin T. ,
Gelfand M. ,
Makeev V. ,
Penin A.
в журнале BMC Genomics , издательство BioMed Central (London) , том 12, № 1, с. 30-30
DOI
2011
The complete genome sequence of Pantoea ananatis AJ13355, an organism with great biotechnological potential
Hara Yoshihiko ,
Kadotani Naoki ,
Izui Hiroshi,
Katashkina Joanna I.,
Kuvaeva Tatiana M. ,
Andreeva Irina G.,
Golubeva Lyubov I.,
Malko Dmitry B. ,
Makeev Vsevolod J. ,
Mashko Sergey V.
в журнале Applied Microbiology and Biotechnology , издательство Springer Verlag (Germany) , том 93, № 1, с. 331-341
DOI
2009
A novel model system for design of biomaterials based on recombinant analogs of spider silk proteins
Bogush V.G. ,
Sokolova O.S. ,
Davydova L.I. ,
Klinov D.V. ,
Sidoruk K.V. ,
Esipova N.G. ,
Neretina T.V. ,
Orchanskyi I.A. ,
Makeev V.Y. ,
Tumanyan V.G. ,
Shaitan K.V. ,
Debabov V.G. ,
Kirpichnikov M.P.
в журнале Journal of NeuroImmune Pharmacology , издательство Springer Verlag (Germany) , том 4, № 1, с. 17-27
2005
A Gibbs sampler for identification of symmetrically structured, spaced DNA motifs with improved estimation of the signal length
Favorov A.V. ,
Gelfand M.S. ,
Gerasimova A.V.,
Ravcheev D.A. ,
Mironov A.A. ,
Makeev V.J.
в журнале Bioinformatics , издательство Oxford University Press (United Kingdom) , том 21, № 10, с. 2240-2245
2005
Assessing computational tools for the discovery of transcription factor binding sites
Tompa M. ,
Li N. ,
Bailey T.L.,
Church G.M. ,
De Moor B. ,
Eskin E. ,
Favorov A.V. ,
Frith M.C.,
Fu Y.T. ,
Kent W.J.,
Makeev V.J. ,
Mironov A.A. ,
Noble W.S. ,
Pavesi G. ,
Pesole G. ,
Regnier M.,
Simonis N.,
Sinha S.,
Thijs G. ,
van Helden J. ,
Vandenbogaert M. ,
Weng Z.P. ,
Workman C. ,
Ye C.,
Zhu Z.
в журнале Nature Biotechnology , издательство Nature Publishing Group (United Kingdom) , том 23, № 1, с. 137-144
1995
Cotranslational folding of proteins
Kolb V.A. ,
Makeyev E.V. ,
Kommer A. ,
Spirin A.S.
в журнале Biochemistry (Moscow), Supplement Series A: Membrane and Cell Biology , издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom) , том 73, № 11-12, с. 1217-1220
Статьи в сборниках
2021
Assessing Ribosome Distribution Along Transcripts with Polarity Scores and Regression Slope Estimates
Vorontsov Ilya E. ,
Egorov Artyom A. ,
Anisimova Aleksandra S. ,
Eliseeva Irina A. ,
Makeev Vsevolod J. ,
Gladyshev Vadim N. ,
Dmitriev Sergey E. ,
Kulakovskiy Ivan V.
в сборнике Methods in Molecular Biology , издательство Springer US (New York, United States) , том 2248, с. 269-294
DOI
Книги
2008
Экология: учебное пособие / под ред проф. В.В.Денисова. – 4-е изд, исправл. и доп
Денисов В.В. ,
Грачев В.А. ,
Азаров В.Н. ,
Бондаренко В.Л. ,
Гутенев В.В. ,
Денисова И.А.,
Дрововозова ,
Т И.,
Камышев А.П. ,
Крючков Г.П. ,
Лопатин К.И.,
Луганская И.А. ,
Макеев В.Н. ,
Москаленко А.П. ,
Нагнибеда Б.А. ,
Спиридонов В.П.,
Теличенко В.И. ,
Хорунжий Б.И.
место издания ИКЦ «МарТ»; Издательский центр «МарТ» Москва; Ростов-на Дону , 768 с.
2007
Промышленная экология: Учебное пособие для студентов высших учебных заведений. / Под редакцией В.А. Грачева. – Изд. 2-ое, перераб. и доп
Азаров В.Н. ,
Ажгиревич А.И. ,
Бондаренко В.Л. ,
Грачев В.А. ,
Гутенев В.В. ,
Денисов В.В. ,
Денисова И.А.,
Камышев А.П. ,
Крючков Г.П. ,
Лопатин К.И.,
Макеев В.Н. ,
Москаленко А.П. ,
Нагнибеда Б.А. ,
Теличенко В.И. ,
Хорунжий Б.И.
место издания ИКЦ «МарТ»; Издательский центр «МарТ» Москва; Ростов-на-Дону , 555 с.
1991
Методические рекомендации по предупреждению гидратообразования на валанжинских УКПГ Уренгойского ГКМ
Истомин В.А.,
Бурмистров А.Г.,
Лакеев В.П. ,
Квон В.Г. ,
Кульков А.Н. ,
Ставицкий В.А. ,
Салихов Ю.Б.,
Ефимов ЮН
место издания М,ВНИИГАЗ, Анализ эффективности различных вариантов нетрадиционного использования летучего ингибитора гидратов метанола. 1991 г., часть 2 Москва , 157 с.
1990
Методические рекомендации по предупреждению гидратообразования на валанжинских УКПГ Уренгойского ГКМ
Истомин В.А.,
Лакеев В.П. ,
Бурмистров А.Г.,
Квон В.Г. ,
Кульков А.Н. ,
Салихов Ю.Б.,
Ставицкий В.А. ,
Ефимов Ю.Н.
место издания М., ВНИИГАЗ, Традиционные схемы применения метанола, ч. 1 Москва , 82 с.
Доклады на конференциях
2020
AD ASTRA: the database of Allelic Dosage-corrected Allele-Specific TRAnscription factor binding suggests causal regulatory sequence variants of pathologies
(Устный)
Авторы:
Abramov S. ,
Boytsov A. ,
Bykova D. ,
Baulin E. ,
Yevshin I. ,
Kolpakov F. ,
Makeev V.J. ,
Kulakovskiy I.V.
BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” , Новосибирск, РФ, Россия, 6-10 июля 2020
2015
Functional transcription factor binding sites from the IL2Ra locus that contain SNPs associated with autoimmune pathologies
(Стендовый)
Авторы:
Shvarts A.M. ,
Putlyaeva L.V. ,
Kasianov A.S. ,
Afanasyeva M.A. ,
Kuprash D.V. ,
Korneev K.V. ,
Kulakovskiy I.V. ,
Makeev V.J. ,
Covich M.
The 40th FEBS Congress , Берлин, Германия, 4-9 июля 2015
Тезисы докладов
Патенты