ИСТИНА

Gingeras Thomas R.

Соавторы: Первушин Д.Д., Davis C.A., Djebali S., Beer M.A., Breschi A., Dobin A., Flicek P., Graveley B., Guigo R., Hardison R., Lagarde J., Stamatoyannopoulos J., Adam F. показать полностью..., Adams L., Alessandra B., Alex D., Alexander R., Alver B., Amrhein H., Andrea T., Antoshechkin I., Arif H., Auerbach R., Baikang P., Bansal M., Bates D., Beal K., Bell K., Bender М., Berstein M., Bickel P., Blobel G., Boeck M., Boley N., Booth B., Boyle A., Brenner S., Brown J., Bussotti G., Byron R., Canfield T., Cao X., Cayting P., Cedric N., Celniker S., Chang C.F., Cheng C., Cheng Y., Cherbas L., Cherbas P., Chris Z., Cline M., Davis R.C., De Bruijn M., DeSalvo G., Denas O., Di_C D.A., Diegel M., Disteche C., Dogan N., Drenkow J., Drenkow J., Duff M., Dunn D.R., Edsall L., Eichler E., Erickson D., Euskirchen G., Ewing B., Fang G., Fastuca M., Fastuca M., Feingold E., Feingold E., Fisher-Aylor K., Frankish A., Gao G., Gerstein M., Gilbert D., Gilchrist D.A., Gillis J., Giovanni B., Giste E., Good P., Good P., Gosh S., Groudine M., Guigó R., Hammonds A., Hansen R., Harmanci A., Harrow J., Haugen E., Herrero J.L., Hillier L., Hinz B., Hoskins R., Howald C., Hu M.L., Huaien W., Huang T.H., Hubbard T., Humbert R., Huynh C., Jain D., Jansen C., Jean M., Jha S.W., Jorg D., Josefowicz S., Julien L., Kahveci T., Kasper D., Kaufman, Kawli T., Keller C., Kellis M., Kent W., King R., Kirilusha A., Kirkup V., Kitchen R., Kuan S., Kundaje A., Kutyavin T., Lacerda d.B., Ladewig E., Lai E., Learned K., Lee D., Lei-Hoon S., Leng M.J., Levasseur D., Lian J., Lin S., Lin Y., Lowdon R., Lu, Ma Z., MacCoss M., Malladi V., Marinov G., Mark G., May G., McCleary D., McWhirter R., Meagan F., Mendenhall E.M., Merrihew G., Michel P., Mishra T., Moore J., Morrissey C., Mortazavi A., Mortazavi A., Murad R., Myers R., Neph S., Neri F., Notredame C., Oliver B., Olson S., Orkin S., Pablo P.B., Papayannopoulou T., Park P.K., Pazin M., Pazin M., Pei B., Perrimon N., Pham K.L., Pignatelli M., Pope B., Prieto P., Ramalho S.M., Rasmussen M., Reh T., Reingold E.M., Reinke V., Ren B., Reymond A., Robinson G., Roderic G., Rosenbloom K., Rozowsky J., Rudensky A.Y., Ryba T., Rynes E., Samstein R., Sandstrom R., Sarah D., Saunders G., Schlesinger F., See L.C., Selleri L., Sethi A., Shen Y., Sisu C., Skoultchi A., Slack F., Sloan C., Snyder J.P., Snyder M., Stoiber M., Strasbourger P., Suganthi B., Tanzer A., Tanzer A., Taylor J., Thompson O., Thurman R., Treuting P., Trout D., Vierstra J., Vong S., Wan K., Wang G., Wang H., Wang S., Wang T.C., Waterston R., Watkins K., Weiss M., Weissman S., Wen C.K., Wen J., Wilken M., Williams D., Wold B., Xue C., Yan K., Yang L., Ye Z., Yip K., Yue F., Zaleski C., Zaleski C., Zhang Y., Zheng H., Zhiping W., Zhong S., Zhou X.Y., Бернштейн Д.М., Сабо П., Шафер М.А., Щербино И.Н.

5 статей, 2 доклада на конференциях

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 1158, Scopus: 1242

IstinaResearcherID (IRID): 7481599

Деятельность

• Статьи в журналах

  • 
    • 2020 Perspectives on ENCODE
    • Snyder Michael P., Gingeras Thomas R., Moore Jill E., Weng Zhiping, Gerstein Mark B., Ren Bing, Hardison Ross C., Stamatoyannopoulos John A., Graveley Brenton R., Feingold Elise A., Pazin Michael J., Pagan Michael, Gilchrist Daniel A., Hitz Benjamin C., Cherry J.Michael, Bernstein Bradley E., Mendenhall Eric M., Zerbino Daniel R., Frankish Adam, Flicek Paul, Myers Richard M.
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 583, № 7818, с. 693-698 DOI
  • 
    • 2016 Gene-specific patterns of expression variation across organs and species
    • Breschi A., Djebali S., Gillis J., Pervouchine DD, Dobin A., Davis CA, Gingeras TR, Guigo R.
    • в журнале Genome Biology, издательство BioMed Central (London), том 17, № 1, с. 151 DOI
  • 
    • 2015 Enhanced transcriptome maps from multiple mouse tissues reveal evolutionary constraint in gene expression
    • Pervouchine Dmitri D., Sarah Djebali, Alessandra Breschi, Davis Carrie A., Pablo Prieto Barja, Alex Dobin, Andrea Tanzer, Julien Lagarde, Chris Zaleski, Lei-Hoon See, Meagan Fastuca, Jorg Drenkow, Huaien Wang, Giovanni Bussotti, Baikang Pei, Suganthi Balasubramanian, Jean Monlong, Arif Harmanci, Mark Gerstein, Beer Michael A., Cedric Notredame, Roderic Guigo, Gingeras Thomas R.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 6, № 5903, с. 1-11 DOI
  • 
    • 2014 A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome" Nature
    • Yue F., Cheng Y., Breschi A., Vierstra J., Wu W., Ryba T., Sandstrom R., Ma Z., Davis C., Pope BD, Shen Y., Pervouchine DD, Djebali S., Thurman RE, Kaul R., Rynes E., Kirilusha A., Marinov GK, Williams BA, Trout D., Amrhein H., Fisher-Aylor K., Antoshechkin I., DeSalvo G., See LH, Fastuca M., Drenkow J., Zaleski C., Dobin A., Prieto P., Lagarde J., Bussotti G., Tanzer A., Denas O., Li K., Bender MA, Zhang M., Byron R., Groudine MT, McCleary D., Pham L., Ye Z., Kuan S., Edsall L., Wu YC, Rasmussen MD, Bansal MS, Kellis M., Keller CA, Morrissey CS, Mishra T., Jain D., Dogan N., Harris RS, Cayting P., Kawli T., Boyle AP, Euskirchen G., Kundaje A., Lin S., Lin Y., Jansen C., Malladi VS, Cline MS, Erickson DT, Kirkup VM, Learned K., Sloan CA, Rosenbloom KR, Lacerda de_Sousa B., Beal K., Pignatelli M., Flicek P., Lian J., Kahveci T., Lee D., Kent WJ, Ramalho Santos M., Herrero J., Notredame C., Johnson A., Vong S., Lee K., Bates D., Neri F., Diegel M., Canfield T., Sabo PJ, Wilken MS, Reh TA, Giste E., Shafer A., Kutyavin T., Haugen E., Dunn D.Reynolds AP, Neph S., Humbert R., Hansen RS, De Bruijn M., Selleri L., Rudensky A., Josefowicz S., Samstein R., Eichler EE, Orkin SH, Levasseur D., Papayannopoulou T., Chang KH, Skoultchi A., Gosh S., Disteche C., Treuting P., Wang Y., Weiss MJ, Blobel GA, Cao X., Zhong S., Wang T., Good PJ, Lowdon RF, Adams LB, Zhou XQ, Pazin MJ, Feingold EA, Wold B., Taylor J., Mortazavi A., Weissman SM, Stamatoyannopoulos JA, Snyder MP, Guigo R., Gingeras TR, Gilbert DM, Hardison RC, Beer MA, Ren B.
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 515, № 7527, с. 355-64 DOI
  • 
    • 2014 Comparative analysis of the transcriptome across distant species" Nature
    • Gerstein MB, Rozowsky J., Yan KK, Wang D., Cheng C., Brown JB, Davis CA, Hillier L., Sisu C., Li JJ, Pei B., Harmanci AO, Duff MO, Djebali S., Alexander RP, Alver BH, Auerbach R., Bell K., Bickel PJ, Boeck ME, Boley NP, Booth BW, Cherbas L., Cherbas P., Di_C Dobin A., Drenkow J., Ewing B., Fang G., Fastuca M., Feingold EA, Frankish A., Gao G., Good PJ, Guigó R., Hammonds A., Harrow J., Hoskins RA, Howald C., Hu L., Huang H., Hubbard TJ, Huynh C., Jha S., Kasper D., Kato M., Kaufman TC, Kitchen RR, Ladewig E., Lagarde J., Lai E., Leng J., Lu Z., MacCoss M., May G., McWhirter R., Merrihew G., Miller DM, Mortazavi A., Murad R., Oliver B., Olson S., Park PJ, Pazin MJ, Perrimon N., Pervouchine D., Reinke V., Reymond A., Robinson G., Samsonova A., Saunders GI, Schlesinger F., Sethi A., Slack FJ, Spencer WC, Stoiber MH, Strasbourger P., Tanzer A., Thompson OA, Wan KH, Wang G., Wang H., Watkins KL, Wen J., Wen K., Xue C., Yang L., Yip K., Zaleski C., Zhang Y., Zheng H., Brenner SE, Graveley BR, Celniker SE, Gingeras TR, Waterston R.
    • в журнале Nature, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 512, № 7515, с. 445-8 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2015 Reconstructing the transcriptional profile of a tissue from the transcriptional profiles of primary cells (Стендовый)
    • Авторы: Pervouchine DD, Breschi A., Djebali S., Gingeras TR, Dobin A., Lagarde J., Guigó R., Davis CA
    • Cold Spring Harbor annual ENCODE meeting, Cold Spring HArbor, США, 7-11 марта 2015
  • • 2014 Common organizational and regulatory features of the human and mouse transcriptomes
    • Авторы: Pervouchine Dmitri D., Alessandra Breschi, Davis Carrie A., Pablo Prieto Barja, Alex Dobin, Julien Lagarde, Roderic Guigo, Gingeras Thomas R., Sarah Djebali
    • Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Boston, USA, 2014