Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИПМех РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
Tyakht A.V.
Соавторы:
Alexeev D.B.
,
Ульянов С.В.
,
Popenko A.
,
Разин С.В.
,
Kostryukova E.
,
Белобородова Н.В.
,
Волох О.И.
,
Черневская Е.А.
,
Berezhnaya Y.
,
Klimenko N.
,
Magnitov M.
,
Васильев П.А.
,
Говорун В.М.
показать полностью...
,
Клименко Н.Н.
,
Larin A.K.
,
Solovyev M.
,
Tkacheva O.
,
Буякова И.В.
,
Гараев А.К.
,
Иванова В.И.
,
Каштанова Д.А.
,
Нестерова П.С.
,
Одинцова В.Е.
,
Паутова А.К.
,
СЕЛЕЗНЕВА О.В.
,
Семашко Т.А.
,
Стражеско И.Д.
,
Шашкова Т.И.
,
Abdulkhakov R.A.
,
Abdulkhakov S.R.
,
Altman S.
,
Altukhov I.
,
Archakov A.I.
,
Babenko V.V.
,
Bobik T.V.
,
Cheremushkin S.V.
,
Dubina M.V.
,
Dudinskaya E.N.
,
Evko G.S.
,
Gachkovskaia A.
,
Gavrilov A.
,
Golov A.K.
,
Grinevich V.B.
,
Gusarov V.
,
Ischenko D.S.
,
Karalkin P.A.
,
Karpova I.Y.
,
Khrustaleva A.
,
Kochetkova T.V.
,
Koshechkin A.P.
,
Kosinsky Y.
,
Kotovskaya Y.
,
Kucheryavyy Y.A.
,
Livzan M.A.
,
Luzhin A.
,
Lyalyukova E.A.
,
Maev I.V.
,
Masson P.
,
Merkel A.Y.
,
Mokrushina Y.
,
Odintsova V.
,
Osakovsky V.
,
Ospanova E.A.
,
Peter J.S.
,
Popov V.
,
REVEL-MUROZ A.
,
SONETS I.
,
Shafranskaya D.
,
Slavskii S.
,
Sobolev A.M.
,
Tolstoganov I.
,
Tsukanov V.V.
,
Vakhrushev I.V.
,
Vanyushkina A.
,
Александрушкина Н.А.
,
Алексеев Д.А.
,
Андрианова Н.В.
,
Ахмадишина Л.В.
,
Байдакова Г.В.
,
Басалова Н.А.
,
Белогуров А.А.
,
Боголюбский Л.И.
,
Букаева И.А.
,
Величко А.К.
,
Ветровой О.В.
,
Владимирцев В.А.
,
Волок В.П.
,
Габибов А.Г.
,
Гавриков А.С.
,
Гаврилов А.А.
,
Галицына А.А.
,
Горбачев А.Ю.
,
Демиденко А.В.
,
Дудинская Е.Н.
,
Дюжева Т.Г.
,
Еремичев Р.Ю.
,
Ефименко А.Ю.
,
Зоров Д.Б.
,
Зорова Л.Д.
,
Ильина Е.Н.
,
КОТОВСКАЯ Ю.В.
,
Кантидзе О.Л.
,
Карагяур М.Н.
,
Карасев И.А.
,
Карганова Г.Г.
,
Киреев И.И.
,
Клабуков И.Д.
,
Ковалева Н.Ю.
,
Кузнецова В.Е.
,
Люндуп А.В.
,
Макаревич П.И.
,
Малихова О.А.
,
Манолов А.И.
,
Мишин А.С.
,
Никитина Р.С.
,
Нимирицкий П.П.
,
Новоселецкая Е.С.
,
Овсянникова Н.Л.
,
Певзнер И.Б.
,
Пеков Ю.А.
,
Платонов Ф.А.
,
Плотников Е.Ю.
,
Пономаренко Н.А.
,
Попков В.А.
,
Райгородский А.М.
,
Романов В.А.
,
Рубцова М.П.
,
Смирнов И.В.
,
Терехов С.С.
,
Ткачук В.А.
,
Фролова О.Ю.
24 статьи
,
8 докладов на конференциях
,
2 тезисов докладов
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 370, Scopus: 187
IstinaResearcherID (IRID): 9281024
Деятельность
Статьи в журналах
2023
RNA-DNA interactomes of three prokaryotes uncovered by proximity ligation
Gavrilov Alexey A.
,
Evko Grigory S.
,
Galitsyna Aleksandra A.
,
Ulianov Sergey V.
,
Kochetkova Tatiana V.
,
Merkel Alexander Y.
,
Tyakht Alexander V.
,
Razin Sergey V.
в журнале
Communications Biology
, издательство
Springer Nature
(Switzerland)
, том 6, № 473
DOI
2022
Hi-C Metagenomics in the ICU: Exploring Clinically Relevant Features of Gut Microbiome in Chronically Critically Ill Patients
Ivanova Valeriia,
Chernevskaya Ekaterina
,
Vasiluev Petr
, Ivanov Artem,
Tolstoganov Ivan
,
Shafranskaya Daria
, Ulyantsev Vladimir, Korobeynikov Anton,
Razin Sergey V.
,
Beloborodova Natalia
,
Ulianov Sergey V.
,
Tyakht Alexander
в журнале
Frontiers in microbiology
, издательство
Frontiers Research Foundation
(Switzerland)
, том 12
DOI
2022
Luminal and Tumor-Associated Gut Microbiome Features Linked to Precancerous Lesions Malignancy Risk: A Compositional Approach
Romanov Vladimir A.
,
Karasev Ivan A.
,
Klimenko Natalia S.
,
Koshechkin Stanislav I.
,
Tyakht Alexander V.
,
Malikhova Olga A.
в журнале
Cancers
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
DOI
2022
Pentad: a tool for distance-dependent analysis of Hi-C interactions within and between chromatin compartments
Magnitov Mikhail D.
,
Garaev Azat K.
,
Tyakht Alexander V.
,
Ulianov Sergey V.
,
Razin Sergey V.
в журнале
BMC Bioinformatics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 23, № 1, с. 1-8
DOI
2021
Host-Microbiome Interactions Mediated by Phenolic Metabolites in Chronically Critically Ill Patients
Chernevskaya Ekaterina
, Klimenko Natalia,
Pautova Alisa
,
Buyakova Irina
,
Tyakht Alexander
,
Beloborodova Natalia
в журнале
Metabolites
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 11, № 2, с. 1-16
DOI
2021
Self-Organization Provides Cell Fate Commitment in MSC Sheet Condensed Areas via ROCK-Dependent Mechanism
Nimiritsky Peter
,
Novoseletskaya Ekaterina
,
Eremichev Roman
,
Alexandrushkina Natalia
,
Karagyaur Maxim
,
Vetrovoy Oleg
,
Basalova Nataliya
,
Khrustaleva Anastasia
,
Tyakht Alexander
,
Efimenko Anastasia
,
Tkachuk Vsevolod
,
Makarevich Pavel
в журнале
BIOMEDICINES
, том 9, № 9
DOI
2021
Suppression of liquid–liquid phase separation by 1,6-hexanediol partially compromises the 3D genome organization in living cells
Ulianov Sergey V.
,
Velichko Artem K.
,
Magnitov Mikhail D.
,
Luzhin Artem V.
,
Golov Arkadiy K.
,
Ovsyannikova Natalia
,
Kireev Igor I.
,
Gavrikov Alexey S.
,
Mishin Alexander S.
,
Garaev Azat K.
,
Tyakht Alexander V.
,
Gavrilov Alexey A.
,
Kantidze Omar L.
,
Razin Sergey V.
в журнале
Nucleic Acids Research
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2021
Temporal dynamics of probiotic Lacticaseibacillus casei and rhamnosus abundance in a fermented dairy product evaluated using a combination of cultivation-dependent and -independent methods
Berezhnaya Yulia
,
Bikaeva Irina
,
Gachkovskaia Anastasiia
,
Demidenko Artem
,
Klimenko Natalia
,
Tyakht Alexander
,
Volokh Olesya
,
Alexeev Dmitry
в журнале
Lebensmittel-Wissenschaft + [i.e. und] Technologie. Food science + technology. Science + technologie alimentaire
, издательство
Academic Press, etc.
(London, etc., England)
, том 148
DOI
2021
Yogurt fortified with vitamins and probiotics impacts the frequency of upper respiratory tract infections but not gut microbiome: A multicenter double-blind placebo controlled randomized study
Odintsova Vera
,
Klimenko Natalia
,
Tyakht Alexander
,
Volokh Olesya
,
Popov Vladimir
,
Alexeev Dmitry
,
Berezhnaya Yulia
в журнале
Journal of Functional Foods
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 83
DOI
2020
Benchmark of software tools for prokaryotic chromosomal interaction domain identification
Magnitov Mikhail D.
, Kuznetsova Veronika S.,
Ulianov Sergey V.
,
Razin Sergey V.
,
Tyakht Alexander V.
в журнале
Bioinformatics
, издательство
Oxford University Press
(United Kingdom)
DOI
2020
FEATURES OF THE GUT MICROBIOTA AS A RISK FACTOR IN CHRONICALLY CRITICALLY ILL PATIENTS
Chernevskaya Ekaterina
,
Beloborodova Natalia V.
,
Buyakova Irina
,
Klimenko Natalia
,
Tyakht Alexander
,
Kovaleva Nadezda
в журнале
Shock
, издательство
Lippincott Williams & Wilkins Ltd.
(United States)
, том 53, № 1S, с. 75-75
DOI
2020
Gut microbiome signature of Viliuisk encephalomyelitis in Yakuts includes an increase in microbes linked to lean body mass and eating behaviour. Orphanet journal of rare diseases
Kuznetsova V.
,
Tyakht A.
,
Akhmadishina L.
,
Odintsova V.
,
Klimenko N.
,
Kostryukova E.
, Vakhitova M., Grigoryeva T., Malanin S.,
Vladimirtsev V.
,
Nikitina R.
,
Volok V.
,
Osakovskiy V.
, Sivtseva T.,
Platonov F.
,
Alexeev D.
,
Karganova G.
в журнале
Orphanet Journal of Rare Diseases
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 15, № 1
DOI
2020
Microbiome-Metabolome Signature of Acute Kidney Injury
Andrianova NV
,
Popkov VA
,
Klimenko NS
,
Tyakht AV
,
Baydakova GV
,
Frolova OY
,
Zorova LD
,
Pevzner IB
,
Zorov DB
,
Plotnikov EY
в журнале
Metabolites
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 10, № 4, с. E142
DOI
2020
Serum and fecal profiles of aromatic microbial metabolites reflect gut microbiota disruption in critically ill patients: a prospective observational pilot study
Chernevskaya Ekaterina
,
Beloborodova Natalia
, Klimenko Natalia,
Pautova Alisa
, Shilkin Dmitrii,
Gusarov Vitaliy
,
Tyakht Alexander
в журнале
Critical Care
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 24, № 1, с. 1-13
DOI
2019
Human Gut Microbiome Response Induced by Fermented Dairy Product Intake in Healthy Volunteers
Olesya Volokh
, Natalia Klimenko, Yulia Berezhnaya,
Alexander Tyakht
,
Polina Nesterova
,
Anna Popenko
,
Dmitry Alexeev
в журнале
Nutrients
, издательство
MDPI Publishing
(Basel, Switzerland, Switzerland)
, том 11, № 3
DOI
2018
Gut Microbiota in Patients with Different Metabolic Statuses: Moscow Study
Kashtanova Daria
,
Tkacheva Olga
,
Doudinskaya Ekaterina
,
Strazhesko Irina
,
Kotovskaya Yulia
,
Popenko Anna
,
Tyakht Alexander
, Alexeev Dmitry
в журнале
Microorganisms
, издательство
MDPI
(Basel, Switzerland)
, том 6, № 4, с. E98
DOI
2018
Knomics-Biota - a system for exploratory analysis of human gut microbiota data
Efimova Daria,
Tyakht Alexander
,
Popenko Anna
, Vasilyev Anatoly,
Altukhov Ilya
, Dovidchenko Nikita,
Odintsova Vera
, Klimenko Natalya, Loshkarev Robert, Pashkova Maria, Elizarova Anna, Voroshilova Viktoriya,
Slavskii Sergei
,
Pekov Yury
, Filippova Ekaterina,
Shashkova Tatiana
, Levin Evgenii,
Alexeev Dmitry
в журнале
BioData Mining
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 11, № 1
DOI
2017
Microfluidic droplet platform for ultrahigh-throughput single-cell screening of biodiversity
Terekhov SS
,
Smirnov IV
, Stepanova AV,
Bobik TV
,
Mokrushina YA
,
Ponomarenko NA
,
Belogurov AA Jr
,
Rubtsova MP
, Kartseva OV, Gomzikova MO, Moskovtsev AA, Bukatin AS,
Dubina MV
,
Kostryukova ES
, Babenko VV, Vakhitova MT,
Manolov AI
, Malakhova MV, Kornienko MA,
Tyakht AV
,
Vanyushkina AA
, Ilina EN,
Masson P.
,
Gabibov AG
,
Altman S.
в журнале
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, издательство
National Academy of Sciences
(United States)
, том 114, № 10, с. 2550-2555
DOI
2017
Билиарная микробиота и заболевания желчных путей
Клабуков И.Д.
,
Люндуп А.В.
,
Дюжева Т.Г.
,
Тяхт А.В.
в журнале
Вестник Российской академии медицинских наук
, том 72, № 3, с. 172-179
DOI
2016
Agent Based Modeling of Human Gut Microbiome Interactions and Perturbations
Shashkova T.
,
Popenko A.
,
Tyakht A.
, Peskov K.,
Kosinsky Yu
,
Bogolubsky L.
,
Raigorodskii A.
, Ischenko D., Alexeev D.,
Govorun V.
в журнале
PLoS Computational Biology
, издательство
Public Library of Science
(United States)
, том 11, № 2, с. 1-26
DOI
2014
RNA-Seq gene expression profiling of HepG2 cells: the influence of experimental factors and comparison with liver tissue
Tyakht A.V.
,
Ilina E.N.
,
Alexeev D.G.
,
Ischenko D.S.
,
Gorbachev A.Y.
,
Semashko T.A.
,
Larin A.K.
,
Selezneva O.V.
,
Kostryukova E.S.
,
Karalkin P.A.
,
Vakhrushev I.V.
, Kurbatov L.K.,
Archakov A.I.
,
Govorun V.M.
в журнале
BMC Genomics
, издательство
BioMed Central
(London)
, том 15, с. 1108
2013
Human gut microbiota community structures in urban and rural populations in Russia
Tyakht A.V.
,
Kostryukova E.S.
,
Popenko A.S.
, Belenikin M.S., Pavlenko A.V.,
Larin A.K.
,
Karpova I.Y.
,
Selezneva O.V.
,
Semashko T.A.
,
Ospanova E.A.
,
Babenko V.V.
,
Maev I.V.
,
Cheremushkin S.V.
,
Kucheryavyy Y.A.
, Shcherbakov P.L.,
Grinevich V.B.
, Efimov O.I., Sas E.I.,
Abdulkhakov R.A.
,
Abdulkhakov S.R.
,
Lyalyukova E.A.
,
Livzan M.A.
, Vlassov V.V., Sagdeev R.Z.,
Tsukanov V.V.
, Osipenko M.F., Kozlova I.V., Tkachev A.V., Sergienko V.I.,
Alexeev D.G.
,
Govorun V.M.
в журнале
Nature communications
, издательство
Nature Pub. Group
(United Kingdom)
, том 4, с. 2469
Статьи в сборниках
2019
Gut Microbiota and Aging
Kashtanova Daria A.
,
Tkacheva Olga N.
,
Strazhesko Irina D.
,
Dudinskaya Ekaterina N.
,
Kotovskaya Yu V.
,
Popenko A.S.
,
Tyaht A.V.
,
Alexeev D.G.
в сборнике
Biomarkers of Human Aging
, место издания
Springer Switzerland
, с. 263-280
2017
Human gut microbiome response induced by fermented dairy product intake
Volokh O.
,
Tyakht A.
,
Berezhnaya Y.
,
Nesterova P.
,
Peter JV St
в сборнике
FASEB Journal
, издательство
Federation of American Societies for Experimental Biology
(United States)
, том 31, с. 965.10-965.10
DOI
Доклады на конференциях
2023
Luminal tumor-associated gut microbiome of young patients with precancerous lesions and early colorectal cancer
(Стендовый)
Авторы:
Karasev Ivan
,
Aginova Viktoriya
,
Malikhova Olga
,
Grigorievskaya Zlata
,
Davydkina Tatyana
, Romanov Vladimir, Klimenko Nataliya,
Koshechkin Stanislav
,
Tyakht Aleksander
European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases
, BELLA CENTER COPENHAGEN Center Boulevard 5, Дания, 15-18 марта 2023
2023
Luminal tumor-associated gut microbiome of young patients with precancerous lesions and early colorectal cancer
(Стендовый)
Авторы:
Karasev Ivan
,
Aginova Viktoriya
,
Malikhova Olga
,
Grigorievskaya Zlata
,
Davydkina Tatyana
, Romanov Vladimir, Klimenko Nataliya,
Koshechkin Stanislav
,
Tyakht Aleksander
European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases
, BELLA CENTER COPENHAGEN Center Boulevard 5, Дания, 15-18 марта 2023
2022
Ингибирование разделения фаз нарушает пространственную организацию хроматина
(Устный)
Авторы:
Ульянов С.В.
,
Величко А.К.
,
Магнитов М.Д.
,
Лужин А.В.
,
Голов А.К.
,
Овсянникова Н.
,
Киреев И.И.
,
Гавриков А.С.
,
Мишин А.С.
,
Гараев А.К.
,
Тяхт А.В.
,
Гаврилов А.А.
,
Кантидзе О.Л.
,
Разин С.В.
III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов
, Сочи, Россия, 3-7 октября 2022
2022
3D-MAGS - SPATIAL CONFORMATIONS OF INDIVIDUAL MICROBIAL GENOMES RECONSTRUCTED FROM HI-C METAGENOMES
(Устный)
Авторы:
REVEL-MUROZ A.
,
SOBOLEV A.
,
SOLOVYEV M.
,
VASILIEV P.
,
ULIANOV S.
,
IVANOVA V.
,
TYAKHT A.
«Биоинформатика и системная биология регуляции и структуры геномов» BGRS/SB-2022
, Новосибирск, Россия, 4-8 июля 2022
2021
Chromosome Conformation of the Hyperthermophilic Archaeon Thermofilum Adornatus
(Устный)
Авторы:
Sobolev A.
,
Solovyev M.
,
Ivanova V.
,
Slepova T.
,
Merkel A.
,
Ulianov S.
,
Tyakht A.
World Microbe Forum, online, June 20–24, 2021
, Онлайн, США, 20-24 июня 2021
2020
Hi-C-assisted chromosome-scale scaffolding of genomes from beer and cider microbiome
(Стендовый)
Авторы:
Valeria Ivanova
,
Vasiliev Petr
,
Solovyev Mikhail
,
Ulianov Sergey
,
Tyakht Alexander
CSHL Microbiome
, США, 20-23 октября 2020
2017
The gut microbiota disturbances in ICU patients with nosocomial pneumonia.
(Стендовый)
Авторы:
Bedova A.
,
Beloborodova N.
,
Pautova A.
,
Klimenko N.
,
Tyakht A.
,
Gusarov V.
8th International Congress ‘‘Sepsis and Multiorgan Dysfunction’’
, г. Веймар, Германия, 6-8 сентября 2017
2017
Human gut microbiome response induced by fermented dairy product intake
(Стендовый)
Авторы:
Berezhnaya Y.
,
Tyakht A.
,
Nesterova P.
,
Peter JV St
,
Volokh O.
Experimental biology 2017
, Чикаго, США, 22 апреля - 27 мая 2017
Тезисы докладов
2022
3D-MAGs – spatial conformations of individual microbial genomes reconstructed from Hi-C metagenomes
REVEL-MUROZ A.
,
SOBOLEV A.
,
SOLOVYEV M.
,
VASILIEV P.
,
ULIANOV S.
,
IVANOVA V.
,
TYAKHT A.
в сборнике
The Thirteenth International Multiconference
, издательство
Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences
(China)
, тезисы
DOI
2022
Investigating bacterial and yeast diversity of spontaneous fermentation beer and cider using Hi-C metagenomics
SONETS I.
,
IVANOVA V.
,
VASILIEV P.
,
ULIANOV S.
,
SOLOVYEV M.
,
TYAKHT A.
в сборнике
The Thirteenth International Multiconference
, издательство
Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences
(China)
, тезисы
DOI