ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИПМех РАН |
||
Потенциал-управляемые калиевые каналы Kv10.2 экспрессируются в нервной системе и их мутантные варианты вовлечены в развитие эпилептической энцефалопатии и аутических симптомов [1], а также в появление и развитие опухолей [2]. Знание пространственной структуры канала и деталей ее организации способствует пониманию механизмов функционирования канала. Целью нашей работы является улучшение ранее полученных моделей этого канала [3, 4] с применением методов моделирования по гомологии и молекулярной динамики. До недавнего времени было доступно несколько шаблонов, в том числе комплекс eag-домена с доменом CNBHD для мышиного канала (pdb-код 4LLO), полноразмерная структура калиевого канала Kv1.2 (pdb-код 3LUT) и другие. В то же время, совсем недавно методом одночастичной криоэлектронной микроскопии была получена структура близкородственного канала Kv10.1 в хорошем разрешении (pdb-код 5K7L) [5], которая прояснила и многие вопросы касательно структуры канала Kv10.2. Однако структура С-концевого фрагмента по-прежнему остается неопределенной. Моделирование на основе дальнеродственных шаблонов позволило получить модель структуры этого фрагмента, которая представляет значительный интерес. Работа поддержана Министерством образования и науки Российской Федерации (грант №14.616.21.0044 от 09.10.2015, проект RFMEFI61615X0044).