![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Разделение фаз играет роль в пространственной и функциональной сегрегации молекулярных процессов в клеточной ядре. Однако, роль этого процесса в установлении и поддержании пространственной организации генома на сегодняшний день ясна не вполне. В данной работе мы использовали микроскопию сверхвысокого разрешения (STORM) и высокопроизводительный метод фиксации конформации хромосом (Hi-C) для исследования изменений в пространственной организации хроматина после обработки клеток 1,6-гександиолом - агентом, супрессирующим разделение фаз. Мы обнаружили, что инкубация клеток с 1,6-гександиолом приводит к увеличению размером нуклеосомных нанодоменов и их более равномерному распределению в пространстве ядра. На масштабах порядка миллиона пар нуклеотидов хроматин претерпевает необратимые изменения структуры, выражающиеся в частичном слиянии А- и В-компартментов. Удаление 1,6-гександиола из среды роста не приводило к восстановлению начальной конфигурации хроматиновой фибриллы, но вело к уплотнению структуры неактивных районов генома. Кроме того, мы обнаружили, что обработка 1,6-гександиолом приводит к ослаблению энхансер-промоторных контактов и сегрегации топологически-ассоциированных доменов, но практически не сказывается на структуре CTCF-зависимых петель. Наши данные свидетельствуют в пользу того, что разделение фаз играет ограниченную роль в пространственной организации хроматина, способствуя его компартментализации.