|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Использование методов биоинформатического анализа для идентификации аминокислотных остатков, ответственных за специфичное связывание рецептора нейраминидазой вируса гриппа Адипломная работа (Бакалавр)
- Научные руководители: Кирилин Е.М., Швядас В.К.
- Автор: Сафина Ксения Радиковна
- Тип: Бакалавр
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2013
- Аннотация: КУРСОВАЯ РАБОТА СТУДЕНТА 2 КУРСА Поверхностный белок вируса гриппа – нейраминидаза – специфично отрезает сиаловую кислоту с поверхности клеток хозяина, играя ключевую роль в распространении инфекции. В связи с этим, изучение молекулярных основ, определяющих специфичность нейраминидазы к рецепторам человеческого и птичьего типа, является важным шагом в понимании механизмов патогенности вируса. Для поиска функциональных позиций нейраминидазы был использован биоинформатический анализ. Поскольку напрямую получить разбиение нейраминидаз на функциональные подсемейства невозможно, в анализе был использован гемагглютинин вируса гриппа, осуществляющий специфичное распознавание тех же рецепторов, что и нейраминидаза, при проникновении вируса внутрь клетки. Как предполагается, специфичность гемагглютинина коэволюционирует со специфичностью нейраминидазы. Разбиение гемагглютинина было получено с использованием мутаций, приводящих к различиям в его субстратной специфичности, известных из литературы. Соответствующая полученному разбиению выборка нейраминидаз была профильтрована и выровнена. В результате биоинформатическго анализа этого выравнивания были получены 43 консервативных и 34 специфических позиции. Большинство остатков, необходимых нейраминидазе для катализа, были найдены консервативными, тогда как обнаруженные специфические позиции не принимают прямого участия в катализе, участвуя в распознавании второго и третьего сахаридных колец рецептора. Некоторые из этих специфических позиций являются объектами действия широкоиспользуемых ингибиторов. Полученные специфические позиции предлагается использовать для анализа с помощью методов молекулярного моделирования с целью выяснения их возможного влияния на процесс связывания субстрата и катализа.
- Добавил в систему: Кирилин Евгений Михайлович