ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИПМех РАН |
||
В данной работе наибольшее внимание уделено моделированию связи структура-динамика-свойства холинэстераз и близких по структуре белков, играющих большую роль в функционировании нервной системы. Цель работы - развитие методики описания структурно-динамических свойств белков методами молекулярного моделирования и применение её к различным системам. В соответствии с поставленной целью решались следующие задачи: 1) выявление закономерностей формирования четвертичной структуры холинэстераз и близких по структуре белков в зависимости от первичной последовательности и динамики мономеров; 2) сравнение структуры и динамики ферментов одного типа различных организмов и их каталитических свойств на примере АХЭ человека и рыбы; 3) исследование влияния точечных мутаций на структурно-динамические свойства и стабильность активного центра фермента на примере БХЭ человека. Для решения поставленных задач были использованы современные методы компьютерной химии: молекулярная динамика с последующим статистическим анализом с применением цепей Маркова; молекулярная динамика с возбуждением свободной энергии; комбинированный метод зонтичной выборки и алгоритма перекрещивающихся распределений для расчёта поверхности свободной энергии; комбинированный метод квантовой механики и молекулярной механики. В результате исследования разработана и применена комбинация методов для качественно и количественного описания структурно-динамических свойств белков. Показаны закономерности стабилизации четвертичной структуры изучаемых белков, Продемонстрировано, что мутант N322E/E325G БХЭ является перспективным для дальнейшего поиска самореактивирующихся мутантов с более высокими скоростями гидролиза ФОС за счёт преобладания формы с активной каталитической триадой при динамических изменениях белка; обнаружено, что различия в кинетике связывания ривастигмина связаны с динамикой белков.
№ | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
---|---|---|---|---|---|
1. | Отзыв официального оппонента | Otzyv_opponenta_kovalenko.pdf | 1,3 МБ | 25 октября 2020 | |
2. | Отзыв на автореферат | 1603481682946_skanirovanie.pdf | 845,8 КБ | 25 октября 2020 | |
3. | Отзыв на автореферат | Otzyv_Bochenkov.pdf | 486,3 КБ | 25 октября 2020 | |
4. | Отзыв на автореферат | otzyv_boyko2.pdf | 342,8 КБ | 27 октября 2020 | |
5. | Отзыв на автореферат | otzyv_Svitanko.pdf | 559,2 КБ | 27 октября 2020 | |
6. | Отзыв официального оппонента | Otzyv_opponenta_mazo_1.pdf | 1,9 МБ | 27 октября 2020 | |
7. | Отзыв официального оппонента | OTZYiV_ot_Nikulina.pdf | 3,3 МБ | 20 октября 2020 | |
8. | Заключение диссертационного совета по диссертации | NovichkovaDA_Zaklyuchenie_dissertatsionnogo_soveta_MGU.pdf | 232,1 КБ | 5 ноября 2020 | |
9. | Сведения об официальных оппонентах, включая публикации | svedeniya_opponenty.pdf | 362,8 КБ | 8 октября 2020 | |
10. | Полный текст диссертации | thesis_Dana-fin.pdf | 5,9 МБ | 15 сентября 2020 | |
11. | Автореферат | Avtoreferat-fin.pdf | 2,2 МБ | 15 сентября 2020 | |
12. | Сведения о научном руководителе | Svedeniya_nauchruk.pdf | 311,6 КБ | 2 сентября 2020 | |
13. | Отзыв научного руководителя/консультанта | NovichkovaDA_Otziv_nauch-final2.pdf | 2,2 МБ | 4 августа 2020 | |
14. | Решение дисс.совета о приеме/отказе к защите | Protokol2.pdf | 192,7 КБ | 13 августа 2020 |