О ВОЗМОЖНОСТИ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ МЕТОДА ПРЯМОЙ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ БЕЛКОВ DIRECTMS1 В ЗАДАЧАХ ХИМИЧЕСКОЙ ПРОТЕОМИКИ ПО ПОИСКУ МИШЕНЕЙ ЛЕКАРСТВЕННОГО ВОЗДЕЙСТВИЯстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Аннотация:На примере клеточной линии рака яичников A2780, обработанной препаратом лонидамин (англ., lonidamine) было проведено полнопротеомное сравнение методов клеточного лизиса, включая метод, основанный на заморозке-разморозке (англ., freeze-thaw), используемый в химической протеомике. На основе литературных данных экспрессионной протеомики по взаимодействию 56 онкопрепаратов с лизатами клеточной линии аденокарциномы легких A549 и результатами полнопротеомного анализа клеточных линий HeLa и A2780 с использованием метода DirectMS1 на основе ультракоротких градиентов разделения получены оценки возможности его использования для мониторинга белков-мишеней лекарственных воздействий. Также, были получены результаты экспрессионной протеомики на основе ультракороткого анализа с использованием метода DirectMS1 для клеточной линии A2780, обработанной лонидамином, и показано, что метод может быть использован для выявления каскадов внутриклеточных белок-белковых взаимодействий, активируемых лекарственным воздействием.