|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИПМех РАН |
||
Выявление участков пластомов потенциально пригодных для метабаркодинга видов растений сем. Poaceaeстатья
- Авторы: Криницына A., Никитина О., Широбоков В., Никитин П., Северова Е.
- Сборник: BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2024). The Fourteenth International Multiconference. Abstracts. August 5–10, 2024, Novosibirsk, Russia
- Год издания: 2024
- Издательство: Institute of archaeology and ethnography SB RAS
- Местоположение издательства: Russian Federation
- Первая страница: 988
- Последняя страница: 991
- Аннотация: Аллергены, содержащиеся в переносимой по воздуху пыльце, вызывают астму и аллергический ринит, от которых страдают около 300 миллионов человек по всему миру. Одним из наиболее распространенных аллергенов является пыльца злаковых (Poaceae). Это семейство включает более 11 000 видов, большинство из которых опыляются ветром. Пыльца злаков присутствует в воздухе в течение очень длительного периода, поэтому пациенты с аллергией на пыльцу злаковых могут страдать от симптомов сезонного аллергического ринита долгое время. Пыльца всех видов злаков относится к единому палиноморфологическому типу и при проведении аэробиологического мониторинга стандартными методами идентифицируется только до уровня семейства. В то же время аллергенность пыльцы разных видов злаков различается, поэтому возникает необходимость детализации кривых пыления. Идентификация биоразнообразия с помощью метабаркодирования представляет собой еще один вариант идентификации состава сложных смесей, в том числе для идентификации и количественного определения пыльцы и образцов из окружающей среды. Наиболее популярными генными маркерами, используемыми для филогенетической классификации, являются внутренние транскрибируемые спейсеры (ITS1 и ITS2), а также участки пластомной ДНК – часть последовательностей генов rbcL и matK. Технология секвенирования длинных участков позволяет расширить спектр маркерных последовательностей, перспективных для определения систематической принадлежности растений в сложных растительных смесях. Цель нашей работы – выявить участки пластомной ДНК, пригодные для определения видовой принадлежности пыльцы злаков в аэробиологических образцах.
- Добавил в систему: Криницына Анастасия Александровна