Статьи в журналах
Тезисы докладов
Доклады на научных конференциях
НИР и НИОКР
Награды и премии
Диссертации
–
Статьи в журналах
-
- 2019 Coding palindromes in mitochondrial genes of Nematomorpha
- Mikhailov Kirill V., Efeykin Boris D., Panchin Alexander Y., Knorre Dmitry A., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Muntyan Maria S., Nikitin Mikhail A., Popova Olga V., Zanegina Olga N., Vyssokikh Mikhail Y., Spiridonov Sergei E., Aleoshin Vladimir V., Panchin Yuri V.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 47, № 13, с. 6858-6870 DOI
-
- 2016 Conserved features of complexes of TATA-box binding proteins with DNA
- Zanegina O.N., Aksianov E.A., Alexeevski A.V., Karyagina A.S., Spirin S.A.
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 14, № 02, с. 1641007 DOI
-
- 2016 An updated version of NPIDB includes new classifications of DNA–protein complexes and their families
- Zanegina O.N., Kirsanov D.D., Baulin E.F., Spirin S.A., Karyagina A.S., Alexeevski A.V.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 44, № D1, с. D144-D153 DOI
-
- 2013 NPIDB: nucleic acid—protein interaction database
- Kirsanov Dmitry D., Zanegina Olga N., Aksianov Evgeniy A., Spirin Sergei A., Karyagina Anna S., Alexeevski Andrei V.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 41, № D1, с. D517-D523 DOI
-
- 2010 Identification of conserved features of LAGLIDADG homing endonucleases
- Grishin Alexander, Fonfara Ines, Alexeevski Andrei, Spirin Sergei, Zanegina Olga, Karyagina Anna, Alexeyevsky Daniil, Wende Wolfgang
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 8, № 3, с. 453-469 DOI
-
- 2008 Conserved water molecules in X-ray structures highlight the role of water in intramolecular and intermolecular interactions
- Aksianov Evgeniy, Zanegina Olga, Grishin Alexander, Spirin Sergey, Karyagina Anna, Alexeevski Andrei
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 6, № 4, с. 775-788 DOI
Тезисы докладов
-
-
- 2014 Structural classification of protein-DNA complexes and their families based on interacting elements
- Zanegina O.N., Karyagina A.S., Alexeevski A.V., Spirin S.A.
- в сборнике Материалы конференции "European Conference on Computational Biology, ECCB 2014", место издания Страсбург, Франция, тезисы
-
- 2014 Contact-based approach to structural classification of protein-DNA complexes
- Zanegina O.N., Karyagina A.S., Alexeevski A.V., Spirin S.A.
- в сборнике The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2014, Novosibirsk, June 23-28, место издания Publishing House of the Siberian Branch Russian Academy of Sciences Novosibirsk, тезисы, с. 170-170
-
- 2003 Гистидин-содержащие дипептиды, обладающие антиоксидантной активностью
- Коршунова Г.А., Сумбатян Н.В., Сыромятникова И.Ф., Занегина О.Н.
- в сборнике Российский симпозиум по химии и биологии пептидов. Тезисы стендовых сообщений, место издания ИБХ РАН Москва, тезисы, с. 30-30
Доклады на научных конференциях
-
- 2018 New automated classification of DNA-protein complexes in Nucleic acids – Protein Interaction Database (Стендовый)
- Авторы: Eugene Baulin, Olga Zanegina, Anna Karyagina, Andrei Alexeevski, Sergei Spirin
- 17th European Conference on Computational Biology (ECCB'18), Athens, Stavros Niarchos Foundation Cultural Center, Greece, 2-12 сентября 2018
-
- 2016 Conserved DNA-protein contacts formed by TATA-box binding proteins (Стендовый)
- Авторы: Andrei Alexeevski, Olga Zanegina, Sergei Spirin, Anna Karyagina, Evgeniy Aksianov
- 15th European Conference on Computational Biology (ECCB'16), г. Гаага, Netherlands, 3-7 сентября 2016
-
- 2016 Search of conserved features in protein-DNA complexesvia Nucleic acid—Protein Interaction DataBase (NPIDB) (Устный)
- Автор: Zanegina O.
- International Conference SocBiN Bioinformatics 2016, Москва, Russia, 14-16 июня 2016
-
- 2015 In search of conserved features in protein-NA complexes: examples of usage of Nucleic acid – Protein Interaction DataBase (NPIDB). (Устный)
- Авторы: Zanegina O., Alexeevski A., Karyagina A., Spirin S.
- Symposium “Enzymes and enzyme complexes acting on nucleic acids” of the International Research Training Group Gießen/Marburg‐Moscow (DFG/RFBR‐funded). 14-15 сентября 2015 года, Гисен, Германия., Гисен, Germany, 14-15 сентября 2015
-
- 2014 Structural classification of protein-DNA complexes and their families based on interacting elements (Стендовый)
- Авторы: Zanegina O.N., Karyagina A.S., Alexeevski A.V., Spirin S.A.
- 13th European Conference on Computational Biology (ECCB'14), Страсбург, France, 7-10 сентября 2014
-
- 2014 Contact-based approach to structural classification of protein-DNA complexes (Стендовый)
- Авторы: Zanegina O.N., Karyagina A.S., Alexeevski A.V., Spirin S.A.
- The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS-2014), Новосибирск, Russia, 23-28 июня 2014
НИР и НИОКР
-
- 1 января 2019 - 31 декабря 2025 Изучение внутри- и межклеточных взаимодействий методами молекулярной и клеточной биологии, физиологии, математики и биоинформатики
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Алексеевский А.В. Ответственные исполнители: Потапова Т.В., Плетюшкина О.Ю., Попова Л.Б., Спирин С.А., Дугина В.Б. Участники НИР: Попов Д.А., Зиновкина Л.А., Чернявский Д.А., Приходько А.С., Диброва Д.В., Мошенский Д.М., Павлова Г.А., Дугина В.Б., Ириоглов Р.А., Домнина Л.В., Зиновкин Р.А., Пирожков Е.В., Смиренина Л.К., Сарайкин С.С., Русинов И.С., Потапова Т.В., Платко О.Н., Яшанова Л.А., Попова Л.Б., Спирин С.А., Панчин Ю.В., Головин А.В., Леонтович А.М., Фокина А.С., Гофман Д.К., Романов А.В., Фетисова Е.К., Таран А.С., Жаров В.Б., Савченко И.М., Жаров В.Б., Перехватов В.В., Баринова О.А., Никитин И.Д., Штратникова В.Ю., Ершова А.С., Челомбитько М.А., Попова Е.Н., Воронов Д.А., Макарикова О.Л., Кирпиченко А.О., Чуркина А.С., Шагиева Г.С., Карягина-Жулина А.С., Занегина О.Н., Смирнов М.С., Сорочкина А.И., Павлюченкова А.Н., Бойцова Л.Ю., Мейзеров Е.С., Черкашина А.А., Синещекова Д.А., Каштанова А.В., Самохина М.Е., Пирусская А.М., Кондратенко Н.Д., Воейкова А.В., Бабаян Б.А., Волобуева М.Е., Волобуева Т.А., Макиевская К.И., Иванова О.Ю., Плетюшкина О.Ю., Селифонов И.В., Бабаян Б.А., Левушкина Ю.Г., Титова Е.В., Вирясова Г.М., Игнатова Т.Ю., Смолина Г.Б., Галкин И.И., Дунина-Барковская А.Я.
-
- 4 августа 2014 - 31 декабря 2015 Изучение эволюции систем рестрикции-модификации методами сравнительной геномики
- Отдел математических методов в биологии
- Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Ершова А.С., Занегина О.Н., Русинов И.С.
-
- 1 августа 2014 - 31 декабря 2014 Проект организации научно-практической школы «Высокопроизводительное секвенирование: получение, анализ данных и их использование в филогенетике»
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Богданов А.А. Участники НИР: Алёшин В.В., Русин Л.Ю., Карпов С.А., Горюнов Д.В., Логачёва М.Д., Михайлов К.В., Игнатов М.С., Занегина О.Н.
-
- 28 марта 2013 - 31 декабря 2015 Развитие биоинформатических сервисов и баз данных на портале НИИ ФХБ имени А.Н.Белозерского на основе разработок новых программ
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Спирин С.А. Участники НИР: Аксянов Е.А., Леонтович А.М., Пеков Ю.А., Николаев В.К., Занегина О.Н.
-
- 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Математика и её применение в биологии и медицине. Биоинформатика
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Попов Д.А., Аксянов Е.А., Диброва Д.В., Мошенский Д.М., Хачатурян М.А., Русинов И.С., Головин А.В., Спирин С.А., Леонтович А.М., Королев Д.Е., Баринова О.А., Штратникова В.Ю., Ершова А.С., Мейзеров Е.С., Карягина-Жулина А.С., Андреева Н.В., Сафонов Н.А., Чернявский Д.А., Занегина О.Н.
-
- 1 апреля 2011 - 31 декабря 2013 Хоминг эндонуклеазы семейства LAGLIDADG и прокариотические системы рестрикции-модификации: распространение, эволюция и рациональный дизайн
- Отдел математических методов в биологии
- Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Гришин А.В., Ершова А.С., Занегина О.Н., Кирсанов Д.Д.
Награды и премии
-
- 2020 Академическая премия
- Лауреаты: Mikhailov Kirill V., Efeykin Boris D., Panchin Alexander Y., Knorre Dmitry A., Logacheva Maria D., Penin Aleksey A., Muntyan Maria S., Nikitin Mikhail A., Popova Olga V., Zanegina Olga N., Vyssokikh Mikhail Y., Spiridonov Sergei E., Aleoshin Vladimir V., Panchin Yuri V.
- НИИ физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского, Россия
Диссертации
-
- 2016 Сравнительная характеристика структур ДНК-белковых комплексов
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (биол. науки)
- Автор: Занегина О.Н., к.б.н.
- Научный руководитель: Спирин С.А., к.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
- Защищена в совете Д 002.077.04 при Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук (ИППИ РАН)
- Организация, в которой выполнялась работа: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова"