ИСТИНА

Svergun D.I.

Соавторы: Петухов М.В., Konarev P.V., Koch M.H., Дадинова Л.А., Jeffries C.M., Штыкова Э.В., Hajizadeh N.R., Mertens H.D., Panjkovich A., Sayers Z., Tuukkanen A., Vanoni M.A., Батищев О.В. показать полностью..., Самыгина В.Р., Andrade Susana L.A., Angelov B., Baumstark M.W., Beermann F., Bernocco S., Bilecen K., Blundell T.L., Bolognesi M., Boris B.S., Brintakis K., Bronstein L.M., Cakmak I., Christodoulou E., Cobucci-Ponzano B., Courtin T., Curry S., Curti B., De Marco V., Deleage G., Duru A.D., Eady N.A., Eichenberger D., Filippov S.K., Franklin J.M., Gherardi E., Gillespie P.J., Greenspan D.S., Hernández A.A., Hoogenboom R., Hruby M., Hulmes D.J., Iliou M.S., Jetten M.S., KAYUSHINA R., Karantzelis N., Klompmaker R., Knekt M., Kuchkina N.V., Lappas A., Lee P., Loshkarev N.A., Lygerou Z., Martins J.C., Mattevi A., Mattsson P.T., Mazzone M., Medema R.H., Mertens H.D., Monie T.P., Morgan D.G., Nemeth V., Nikoshvili L.Z., Nilges M., Ozturk U.H., Papadakis C.M., Pflüger T., Radulescu A., Ravasio S., Ricard-Blum S., Rogers S., Ruggiero F., Saraste M., Sattler M., Scheffzek K., Sezerman U.O., Spilotros A., Starovoitova L., Steiglitz B.M., Stein B.D., Stepanek P.c., Sulman E.M., Sutlu T., Taraviras S., Vande Woude G.F., Verbraeken B., Vertessy B.G., Vishnevetskaya N.S., Weissenhorn W., Westlund A., Youles M.E., Zuccotti S., van Gerwen S., van den Heuvel R.H., van den Heuvel R.H., Бакаева М.А., Баратова Л.А., Борисова Ю.А., Васильев В.С., Волынский П.Е., Голубева И.С., Горбунов Н.В., Калитин Н.Н., Карамышева А.Ф., Кислицын Ю.А., Кихней А.Г., Конарев П.В., Конарев П.В., Костарев А.В., Костевич В.А., Кострица Н.С., Кравченко В.С., Ксенофонтов А.Л., Лапук В.А., Лунин В.Ю., Лушникова А.А., Потемкин И.И., Сивиринова А.С., Смирнова Г.Б., Соколов А.В., Сульман М.Г., Ташкин В.Ю., Федорова Н.В., Федорова Н.В., Эктова Л.В., Юзик-Климова Е.Ю.

30 статей, 8 докладов на конференциях, 2 тезисов докладов

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 3982, Scopus: 4104

IstinaResearcherID (IRID): 48439313

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2022 A novel glycosylated indolocarbazole derivative LCS1269 effectively inhibits growth of human cancer cells in vitro and in vivo through driving of both apoptosis and senescence by inducing of DNA damage and modulating
    • Kalitin NN, Ektova LV, Kostritsa NS, Sivirinova AS, Kostarev A.V., Smirnova G.B., Borisova Y.A., Golubeva I.S., Ermolaeva E.V., Vergun M.A., Babaeva M.A., Lushnikova A.A., Karamysheva A.F.
    • в журнале Chemico-Biological Interactions, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 364 DOI
  • • 2020 КВАЗИАТОМИСТИЧЕСКИЙ ПОДХОД К МОДЕЛИРОВАНИЮ ЛИПОСОМ
    • Петухов М.В., Конарев П.В., Дадинова Л.А., Федорова Н.В., Волынский П.Е., Свергун Д.И., Батищев О.В., Штыкова Э.В.
    • в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 65, № 2, с. 266-271 DOI
  • 
    • 2019 Solution Structure, Self-Assembly, and Membrane Interactions of the Matrix Protein from Newcastle Disease Virus at Neutral and Acidic pH
    • Shtykova E.V., Petoukhov M.V., Dadinova L.A., Fedorova N.V., Tashkin V.Yu, Timofeeva T.A., Ksenofontov A.L., Loshkarev N.A., Baratova L.A., Jeffries C.M., Svergun D.I., Batishchev O.V.
    • в журнале Journal of Virology, издательство American Society for Microbiology (United States), том 93, № 6, с. e01450-18 DOI
  • • 2018 Signaling ammonium across membranes through an ammonium sensor histidine kinase
    • Pflüger Tobias, Hernández Camila F., Lewe Philipp, Frank Fabian, Mertens Haydyn, Svergun Dmitri, Baumstark Manfred W., Lunin Vladimir Y., Jetten Mike S.M., Andrade Susana L.A.
    • в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 9, № 1 DOI
  • 
    • 2018 Small-Angle X-ray Scattering Study of Macrophage Migration Inhibitory Factor Complexed with Albumin
    • Petoukhov M.V., Sokolov A.V., Dadinova L.A., Gorbunov N.P., Svergun D.I., Samygina V.R.
    • в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 63, № 4, с. 589-593 DOI
  • 
    • 2017 ATSAS 2.8: a comprehensive data analysis suite for small-angle scattering from macromolecular solutions
    • Franke D., Petoukhov M.V., Konarev P.V., Panjkovich A., Tuukkanen A., Mertens H.D.T, Kikhney A.G., Hajizadeh N.R., Franklin J.M., Jeffries C.M., Svergun D.I.
    • в журнале Journal of Applied Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 50, № 4, с. 1212-1225 DOI
  • 
    • 2017 Block and Gradient Copoly(2-oxazoline) Micelles: Strikingly different on the Inside
    • Filippov S.K., Verbraeken B., Konarev P.V., Svergun D.I., Angelov B., Vishnevetskaya N.S., Papadakis C.M., Rogers S., Radulescu A., Courtin T., Martins J.C., Starovoitova L., Hruby M., Stepanek P., Kravchenko V.S., Potemkin I.I., Hoogenboom R.
    • в журнале Journal of Physical Chemistry Letters, издательство American Chemical Society (United States), том 8, с. 3800-3804 DOI
  • 
    • 2014 Endophilin-A1 BAR domain interaction with arachidonyl CoA
    • Petoukhov M.V., Weissenhorn W., Svergun D.I.
    • в журнале Frontiers in Molecular Biosciences, издательство Frontiers Media S.A. (Lausanne, Switzerland), том 1, № 20, с. 1-8 DOI
  • 
    • 2014 HYDROPHOBIC PERIPHERY TAILS OF POLYPHENYLENEPYRIDYL DENDRONS CONTROL NANOPARTICLE FORMATION AND CATALYTIC PROPERTIES
    • Kuchkina N.V., Yuzik-Klimova E.Yu, Shifrina Z.B., Bronstein L.M., Morgan D.G., Boris B.S., Stein B.D., Kostopoulou A., Lappas A., Brintakis K., Svergun D.I., Spilotros A., Sulman M.G., Nikoshvili L.Zh, Sulman E.M.
    • в журнале Chemistry of Materials, издательство American Chemical Society (United States), том 26, № 19, с. 5654-5663 DOI
  • 
    • 2009 Quaternary structure of the human Cdt1-Geminin complex regulates DNA replication licensing
    • De Marco V., Gillespie P.J., Li A., Karantzelis N., Christodoulou E., Klompmaker R., van Gerwen S., Fish A., Petoukhov M.V., Iliou M.S., Lygerou Z., Medema R.H., Blow J.J., Svergun D.I., Taraviras S., Perrakis A.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 106, № 47, с. 19807-19812 DOI
  • 
    • 2008 A structure refinement protocol combining NMR residual dipolar couplings and small angle scattering restraints
    • Gabel F., Simon B., Nilges M., Petoukhov M., Svergun D., Sattler M.
    • в журнале Journal of Biomolecular NMR, издательство Springer Nature (Switzerland), том 41, № 4, с. 199-208 DOI
  • 
    • 2006 A retroviral dUTPase: modulatory effect of flexible segments on protein structure and function
    • Nemeth V., Barabas O., Fuxreiter M., Svergun D., Petoukhov M., Vertessy B.G.
    • в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 273, № 1, с. 312
  • 
    • 2006 ATSAS 2.1, a program package for small-angle scattering data analysis
    • Konarev P.V., Petoukhov M.V., Volkov V.V., Svergun D.I.
    • в журнале Journal of Applied Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 39, № 2, с. 277-286 DOI
  • 
    • 2006 Conformation of polypyrimidine tract binding protein in solution
    • Petoukhov M.V., Monie T.P., Allain F.H.T, Matthews S., Curry S., Svergun D.I.
    • в журнале Structure, издательство Cell Press (United States), том 14, № 6, с. 1021-1027 DOI
  • 
    • 2006 Structural basis of hepatocyte growth factor/scatter factor and MET signalling
    • Gherardi E., Sandin S., Petoukhov M.V., Finch J., Youles M.E., Ofverstedt L.G., Miguel R.N., Blundell T.L., Vande Woude G.F., Skoglund U., Svergun D.I.
    • в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 103, № 11, с. 4046-4051 DOI
  • 
    • 2005 Global rigid body modeling of macromolecular complexes against small-angle scattering data
    • Petoukhov M.V., Svergun D.I.
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 89, № 2, с. 1237-1250 DOI
  • 
    • 2005 Triticum durum metallothionein - Isolation of the gene and structural characterization of the protein using solution scattering and molecular modeling
    • Bilecen K., Ozturk U.H., Duru A.D., Sutlu T., Petoukhov M.V., Svergun D.I., Koch M.H.J, Sezerman U.O., Cakmak I., Sayers Z.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 280, № 14, с. 13701-13711
  • 
    • 2004 Structural characterization of the nonameric assembly of an Archaeal alpha-L-fucosidase by synchrotron small angle X-ray scattering
    • Rosano C., Zuccotti S., Cobucci-Ponzano B., Mazzone M., Rossi M., Moracci M., Petoukhov M.V., Svergun D.I., Bolognesi M.
    • в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 320, № 1, с. 176-182 DOI
  • 
    • 2003 Conformation of full-length Bruton tyrosine kinase (Btk) from synchrotron X-ray solution scattering
    • Marquez J.A., Smith C.I.E, Petoukhov M.V., Lo Surdo P., Mattsson P.T., Knekt M., Westlund A., Scheffzek K., Saraste M., Svergun D.I.
    • в журнале EMBO Journal, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 22, № 18, с. 4616-4624 DOI
  • 
    • 2003 Low resolution structure determination shows procollagen C-proteinase enhancer to be an elongated multidomain glycoprotein
    • Bernocco S., Steiglitz B.M., Svergun D.I., Petoukhov M.V., Ruggiero F., Ricard-Blum S., Ebel C., Geourjon C., Deleage G., Font B., Eichenberger D., Greenspan D.S., Hulmes D.J.S
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 278, № 9, с. 7199-7205 DOI
  • 
    • 2003 Low resolution structure of immunoglobulins IgG1, IgM and rheumatoid factor IgM-RF from solution X-ray scattering data
    • Volkov V.V., Kajushina R.L., Lapuk V., A, Shtykova E.V., Varlamova E.Yu, Malfois M., Svergun D.I.
    • в журнале Journal of Applied Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 36, с. 503-508
  • 
    • 2003 New methods for domain structure determination of proteins from solution scattering data
    • Petoukhov M.V., Svergun D.I.
    • в журнале Journal of Applied Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 36, № 3, 1, с. 540-544 DOI
  • 
    • 2003 Quaternary structure of Azospirillum brasilense NADPH-dependent glutamate synthase in solution as revealed by synchrotron radiation x-ray scattering
    • Petoukhov M.V., Svergun D.I., Konarev P.V., Ravasio S., van den Heuvel R.H.H, Curti B., Vanoni M.A.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 278, № 32, с. 29933-29939 DOI
  • • 2003 Structural characterisation of T-protein of the Escherichia coli glycine cleavage system by X-ray small angle scattering
    • Orun O., Koch M.H.J, Kan B., Svergun D.I., Petoukhov M.V., Sayers Z.
    • в журнале Cellular and Molecular Biology, издательство C M B Association (France), том 49, с. 453-459
  • 
    • 2003 The active conformation of glutamate synthase and its binding to ferredoxin
    • van den Heuvel R.H.H, Svergun D.I., Petoukhov M.V., Coda A., Curti B., Ravasio S., Vanoni M.A., Mattevi A.
    • в журнале Journal of Molecular Biology, издательство Academic Press (United States), том 330, № 1, с. 113-128 DOI
  • 
    • 2002 Addition of missing loops and domains to protein models by X-ray solution scattering
    • Petoukhov M.V., Eady N.A.J, Brown K.A., Svergun D.I.
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 83, № 6, с. 3113-3125
  • 
    • 2001 Determination of domain structure of proteins from X-ray solution scattering
    • Svergun D.I., Petoukhov M.V., Koch M.H.J
    • в журнале Biophysical Journal, издательство Biophysical Society (United States), том 80, № 6, с. 2946-2953
  • 
    • 2001 MASSHA - a graphics system for rigid-body modelling of macromolecular complexes against solution scattering data
    • Konarev P.V., Petoukhov M.V., Svergun D.I.
    • в журнале Journal of Applied Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 34, № 4, с. 527-532 DOI
  • 
    • 2000 Crystal versus solution structures of thiamine diphosphate-dependent enzymes
    • Svergun D.I., Petoukhov M.V., Koch M.H.J, Konig S.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 275, № 1, с. 297-302 DOI

• Статьи в сборниках

  • 
    • 2012 Small Angle X-Ray Scattering/Small Angle Neutron Scattering as Methods Complementary to NMR
    • Petoukhov M.V., Svergun D.I.
    • в сборнике NMR of Biomolecules. Towards Mechanistic Systems Biology (Bertini I., McGreevy K.S., Parigi G., eds.), издательство Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA (Weinheim, Germany), с. 563-574 DOI

• Доклады на конференциях

  • • 2017 Анализ структуры биологических макромолекул по данным малоуглового рассеяния с помощью программного пакета ATSAS (Устный)
    • Авторы: Петухов М.В., Franke D., Конарев П.В., Panjkovich A., Tuukkanen A., Mertens H.D.T, Кихней А.Г., Hajizadeh N.R., Jeffries C.M., Свергун Д.И.
    • Совещание пользователей Курчатовского комплекса синхротронно-нейтронных исследований (20 – 23 ноября 2017 года), Москва, Россия, 20-23 ноября 2017
  • • 2017 Применение гибридных структурных методов с использованием синхротронного излучения для исследования белок-белковых комплексов (Устный)
    • Авторы: Буренков Г., Васильев В.Б., Дадинова Л.А., Дубова К.М., Петухов М.В., Самыгина В.Р., Соколов А.В., Свергун Д.И.
    • Совещание пользователей Курчатовского комплекса синхротронно-нейтронных исследований (20 – 23 ноября 2017 года), Москва, Россия, 20-23 ноября 2017
  • • 2017 Анализ cтруктуры белков по данным малоуглового рассеяния с помощью программного пакета ATSAS (Стендовый)
    • Авторы: Петухов М.В., Franke D., Конарев П.В., Panjkovich A., Tuukkanen A., Mertens H.D.T, Кихней А.Г., Hajizadeh N.R., Jeffries C.M., Свергун Д.И.
    • 12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
  • • 2017 Структурные исследования взаимодействия фактора ингибирования миграции макрофагов с альбумином (Стендовый)
    • Авторы: Петухов М.В., Соколов А.В., Дадинова Л.А., Костевич В.А., Кислицын Ю.А., Самыгина В.Р., Васильев В.Б., Свергун Д.И.
    • 12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", Москва, Россия, 18-22 сентября 2017
  • • 2017 ATSAS 2.8: a comprehensive data analysis suite for small-angle scattering from macromolecular solutions (Стендовый)
    • Авторы: Petoukhov M.V., Konarev P.V., Franke D., Panjkovich A., Tuukkanen A., Mertens H.D.T, Kikhney A.G., Hajizadeh N.R., Franklin J.M., Jeffries C.M., Svergun D.I.
    • 24th IUCR Congress , Hyderabad, Индия, 21-28 августа 2017
  • • 2017 Ambiguity Assessment of Small-Angle Scattering Curves from Monodisperse Homogeneous Systems (Устный)
    • Авторы: Svergun D.I., Petoukhov M.V.
    • Molecular System Sciences: Grand Challenges in Small-angle Scattering, Okazaki, Япония, 18-20 марта 2017
  • • 2016 Развитие методов автоматической суперпозиции макромолекулярных моделей. (Устный)
    • Авторы: Конарев П.В., Свергун Д.И., Петухов М.В.
    • Первый Российский кристаллографический конгресс, Москва, Россия, 21-26 ноября 2016
  • • 2006 Structural Insight into Intermediate Filament Assembly Using Small-Angle X-ray Scattering. (Стендовый)
    • Авторы: Sokolova A.V., Kurochkina L.P., Svergun D.I., Wedig T., Herrmann H., Aebi U., Strelkov S.V., Kreplak L.
    • 23th European Crystallographic Meeting , Leuven, 2006

• Тезисы докладов

  • • 2017 Анализ cтруктуры белков по данным малоуглового рассеяния с помощью программного пакета ATSAS
    • Петухов М.В., Franke D., Конарев П.В., Panjkovich A., Tuukkanen A., Mertens H.D.T, Кихней А.Г., Hajizadeh N.R., Jeffries C.M., Свергун Д.И.
    • в сборнике НАУЧНЫЕ ТРУДЫ ОБЪЕДИНЁННЫЙ НАУЧНЫЙ ФОРУМ МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ ПО БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ «XII ЧТЕНИЯ ПАМЯТИ АКАДЕМИКА ЮРИЯ АНАТОЛЬЕВИЧА ОВЧИННИКОВА» VIII РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ», серия Acta Naturae, Спецвыпуск 2017, место издания Парк-медиа Москва, том 9, тезисы, с. 107-108
  • • 2017 Структурные исследования взаимодействия фактора ингибирования миграции макрофагов с альбумином
    • Самыгина В.Р., Петухов М.В., Соколов А.В., Дадинова Л.А., Костевич В.А., Кислицын Ю.А., Васильев В.Б., Свергун Д.И.
    • в сборнике НАУЧНЫЕ ТРУДЫ ОБЪЕДИНЁННЫЙ НАУЧНЫЙ ФОРУМ МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ ПО БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ «XII ЧТЕНИЯ ПАМЯТИ АКАДЕМИКА ЮРИЯ АНАТОЛЬЕВИЧА ОВЧИННИКОВА» VIII РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ», серия Acta Naturae, Спецвыпуск 2017, место издания Парк-медиа Москва, том 9, тезисы, с. 109-109