Статьи в журналах
Доклады на научных конференциях
НИР и НИОКР
Членство в научных обществах
Диссертации
Руководство дипломными работами
Руководство курсовыми работами
Авторство учебных курсов
Преподавание учебных курсов
–
Статьи в журналах
-
- 2023 Regulation of Cell Proliferation and Nrf2-Mediated Antioxidant Defense: Conservation of Keap1 Cysteines and Nrf2 Binding Site in the Context of the Evolution of KLHL Family
- Shilovsky Gregory A., Dibrova Daria V.
- в журнале Life, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 13, № 4, с. 1045 DOI
-
- 2022 Common Patterns of Hydrolysis Initiation in P-loop Fold Nucleoside Triphosphatases
- Kozlova Maria I., Shalaeva Daria N., Dibrova Daria V., Mulkidjanian Armen Y.
- в журнале Biomolecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 12, № 10, с. 1345 DOI
-
- 2022 Common Mechanism of Activated Catalysis in P-Loop Fold Nucleoside Triphosphatases—United in Diversity
- Kozlova Maria I., Shalaeva Daria N., Dibrova Daria V., Mulkidjanian Armen Y.
- в журнале Biomolecules, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 12, № 10, с. 1346 DOI
-
- 2022 The role of Tyr102 residue in the functioning of bacterial NAD+-dependent formate dehydrogenase of Pseudomonas sp. 101
- Popinako A.V., Pometun A.A., Nilov D.K., Dibrova D.V., Khrustalev V.V., Khrustaleva T.A., Iurchenko T.S., Nikolaeva A.Yu, Švedas V.K., Boyko K.M., Tishkov V.I., Popov V.O.
- в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 616, с. 134-139 DOI
-
- 2020 Экспансия «Натриевого мира» сквозь эволюционное время и таксономическое пространство
- Козлова М.И., Бушмакин И.М., Беляева Ю.Д., Шалаева Д.Н., Диброва Д.В., Черепанов Д.А., Мулкиджанян А.Я.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 85, № 12, с. 1788-1815 DOI
-
- 2020 Expansion of the “Sodium World” through Evolutionary Time and Taxonomic Space
- Kozlova M.I., Bushmakin I.M., Belyaeva J.D., Shalaeva D.N., Dibrova D.V., Cherepanov D.A., Mulkidjanian A.Y.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 85, № 12, с. 1518-1542 DOI
-
- 2018 Identification of branched-chain amino acid aminotransferases active towards (R)-(+)-1-phenylethylamine among PLP fold type IV transaminases
- Bezsudnova E.Yu, Dibrova D.V., Nikolaeva A.Yu, Rakitinaa T.V., Popov V.O.
- в журнале Journal of Biotechnology, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 271, с. 26-28 DOI
-
- 2018 Analysis of the interactions between GMF and Arp2/3 complex in two binding sites by molecular dynamics simulation
- Popinako A., Antonov M., Dibrova D., Chemeris A., Sokolova O.S.
- в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications, издательство Academic Press (United States), том 496, № 2, с. 529-535 DOI
-
- 2017 Emergence of cytochrome bc complexes in the context of photosynthesis
- Dibrova D.V., Shalaeva D.N., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
- в журнале Physiologia Plantarum, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 161, № 1, с. 150-170 DOI
-
- 2017 COGcollator: A web service for analysis of distant relationships between homologous protein families
- Dibrova DV, Konovalov KA, Perekhvatov V.V., Skulachev KV, Mulkidjanian AY
- в журнале Biology Direct, издательство BioMed Central (London), том 12, № 29 DOI
-
- 2017 COGNAT: A web service for comparative analysis of genomic neighborhoods
- Klimchuk O.I., Konovalov KA, Perekhvatov V.V., Skulachev KV, Dibrova DV, Mulkidjanian AY
- в журнале Biology Direct, издательство BioMed Central (London), том 12, № 26 DOI
-
- 2016 Phylogenomic analysis identifies a sodium-translocating decarboxylating oxidoreductase in thermotogae
- Klimchuk OI, Dibrova DV, Mulkidjanian AY
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 5, с. 481-490 DOI
-
- 2016 Phylogenomic analysis of type 1 NADH:Quinone oxidoreductase
- Novakovsky G.E., Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 81, № 7, с. 770-784 DOI
-
- 2016 Филогеномный анализ НАДН:хинон оксидоредуктаз типа I
- Новаковский Г.Э., Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 81, № 6, с. 813-829
-
- 2016 Натрий-переносящая декарбоксилирующая оксидоредуктаза у термотог?
- Климчук О.И., Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 81, № 5, с. 644-654
-
- 2015 Modeling of interaction between cytochrome c and the WD domains of Apaf-1: bifurcated salt bridges underlying apoptosome assembly
- Shalaeva DN, Dibrova DV, Galperin MY, Mulkidjanian AY
- в журнале Biology Direct, издательство BioMed Central (London), том 10, № 29 DOI
-
- 2015 Ancient Systems of Sodium/Potassium Homeostasis as Predecessors of Membrane Bioenergetics
- Dibrova DV, Galperin MY, Koonin EV, Mulkidjanian AY
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 80, № 5, с. 495-516 DOI
-
- 2014 Phylogenomic reconstruction of archaeal fatty acid metabolism
- Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
- в журнале Environmental Microbiology, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 16, № 4, с. 907-918 DOI
-
- 2013 Evolution of cytochrome bc complexes: from membrane-anchored dehydrogenases of ancient bacteria to triggers of apoptosis in vertebrates
- Dibrova D.V., Cherepanov D.A., Galperin M.Y., Skulachev V.P., Mulkidjanian A.Y.
- в журнале Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1827, № 11-12, с. 1407-1427 DOI
-
- 2012 The Role of Energy in the Emergence of Biology from Chemistry
- Dibrova D.V., Chudetsky M.Y., Galperin M.Y., Koonin E.V., Mulkidjanian A.Y.
- в журнале Origins of Life and Evolution of the Biosphere, издательство Springer Nature (Switzerland) DOI
-
- 2012 Open Questions on the Origin of Life at Anoxic Geothermal Fields
- Mulkidjanian A.Y., Bychkov A.Y., Dibrova D.V., Galperin M.Y., Koonin E.V.
- в журнале Origins of Life and Evolution of the Biosphere, издательство Springer Nature (Switzerland) DOI
-
- 2012 Origin of first cells at terrestrial, anoxic geothermal fields
- Mulkidjanian Armen Y., Bychkov Andrew Yu, Dibrova Daria V., Galperin Michael Y., Koonin Eugene V.
- в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, издательство National Academy of Sciences (United States), том 109, № 14, с. E821-E830 DOI
-
- 2012 The cytochrome bc(1) complex and the evolution of membrane bioenergetics
- Dibrova Daria V., Galperin Michael Y., Mulkidjanian Armen Y.
- в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1817, с. S91 DOI
-
- 2012 Comparative analysis of lipid biosynthesis in archaea, bacteria and eukaryotes: What was the structure of the first membrane lipids?
- Dibrova Daria V., Makarova Kira S., Galperin Michael Y., Koonin Eugene V., Mulkidjanian Armen Y.
- в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1817, с. S154 DOI
-
- 2010 Characterization of the N-ATPase, a distinct, laterally transferred Na+-translocating form of the bacterial F-type membrane ATPase
- Dibrova Daria V., Galperin Michael Y., Mulkidjanian Armen Y.
- в журнале Bioinformatics, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 26, № 12, с. 1473-1476 DOI
Доклады на научных конференциях
-
- 2018 Bioinformatic analysis of prokaryotic F-type ATP synthase operons (Стендовый)
- Авторы: Фенюк Б.А., Холина Т.Д., Диброва Д.В.
- 20th European Bioenergetics Conference, Будапешт, Hungary, 25-30 августа 2018
-
- 2018 Inspecting COGs with COGcollator as a method to avoid pitfalls in phylogenomic analysis (Стендовый)
- Авторы: Perekhvatov V.V., Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y., Skulachev K.V., Konovalov K.A.
- V Moscow International Conference «MOLECULAR PHYLOGENETICS AND BIODIVERSITY BIOBANKING», МГУ имени М.В.Ломоносова, Russia, 25-29 августа 2018
-
- 2016 Emergence of cytochrome bc complexes in the context of photosynthesis (Устный)
- Авторы: Mulkidjanian A.Y., Dibrova D.V.
- Международная конференция Photosynthetic and Respiratory complexes: from structure to function, Вервьерс, Belgium, 13 августа 2016 - 15 января 2017
-
- 2015 Role of monovalent cations in P-loop nucleoside triphosphatases (Стендовый)
- Авторы: Cherepanov D.A., Shalaeva D.N., Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
- 6th European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics, Goettingen, Germany, 29 сентября - 2 октября 2015
-
- 2015 Phylogenomic analysis of the type I NADH:quinone-oxidoreductase (Стендовый)
- Авторы: Novakovsky G.E., Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y.
- Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Russia, 16-19 июля 2015
-
- 2015 OLESA: Operon Loci Examination and Sorting Application (Стендовый)
- Авторы: Klimchuk O.I., Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y.
- Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, Russia, 16-19 июля 2015
-
- 2015 Emergence of Membrane Bioenergetics and Its Coupling to Redox and Photosynthetic Enzymes (Приглашенный)
- Авторы: Mulkidjanian A.Y., Dibrova D.V., Galperin M.Y.
- 2nd Astrobiology Science Conference, Чикаго, United States, 15-19 июня 2015
-
- 2014 Reconstruction of the primordial "Sodium World" (Стендовый)
- Авторы: Dibrova D.V., Mulkidjanian A.Y.
- 18-th European Bioenergetics Conference , Lisbon, Portugal, Portugal, 12-17 июля 2014
-
- 2014 Archaeal pathway(s) of fatty acid metabolism and lipids of the Last Universal Cellular Ancestor (Устный)
- Авторы: Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
- 10-th International Congress on Extremophiles, St.Petersburg, 7-11 September, 2014 , 2014
-
- 2013 Сomparative analysis of lipid biosynthesis in bacteria and archaea: an update on co-evolution of membranes and membrane bioenergetics (Устный)
- Авторы: Dibrova D.V., Makarova K.S., Galperin M.Y., Koonin E.V., Mulkidjanian A.Y.
- Proceedings of the 3rd D/UK Conference on Bioenergetics (DUKBEC), Rauischholzhausen, Germany, Germany, 2013
-
- 2012 Comparative analysis of lipid biosynthesis in archaea, bacteria and eukaryotes: What was the structure of the first membrane lipids? (Устный)
- Авторы: Dibrova D.V., Makarova K.S., Galperin M.Y., Koonin E.V., Mulkidjanian A.Y.
- European Bioenergetic Conference (EBEC), Freiburg, Germany, Germany, 2012
-
- 2012 The cytochrome bc1 complex and the evolution of membrane bioenergetics (Устный)
- Авторы: Dibrova D.V., Galperin M.Y., Mulkidjanian A.Y.
- European Bioenergetic Conference (EBEC), Freiburg, Germany, Germany, 2012
-
- 2012 Comparative analysis of lipid biosynthesis in archaea, bacteria and eukaryotes: What was the structure of the first membrane lipids? (Устный)
- Авторы: Dibrova D.V., Makarova K.S., Galperin M.Y., Koonin E.V., Mulkidjanian A.Y.
- The 3rd Moscow International Conference "Molecular Phylogenetics"(MolPhy-3), Moscow, Russia, 2012
НИР и НИОКР
-
- 1 января 2023 - 31 декабря 2024 Разработка магистрской программы “Применение машинного обучения в биологии”
- Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Руководитель: Фенюк Б.А. Ответственные исполнители: Буян М.И., Диброва Д.В., Жарикова А.А., Зинкевич А.О., Зиновкин Р.А., Калайдзидис Я.Л., Карелина Н.А., Логачева М.Д., Манских В.Н., Маслова В.Д., Миронов А.А., Пензар Д.Д., Приходько А.С., Раменский В.Е., Русинов И.С., Хайрова С.Р.
-
- 16 сентября 2020 - 23 января 2024 Выявление структурно-динамических особенностей мутантных форм белка-предшественника бета-амилоидов методами молекулярного моделирования и спектрального анализа
- ФИЦ Биотехнологии РАН
- Руководитель: Попинако А.В. Ответственные исполнители: Зайчик Б.Ц., Диброва Д.В.
-
- 1 января 2019 - 31 декабря 2025 Изучение внутри- и межклеточных взаимодействий методами молекулярной и клеточной биологии, физиологии, математики и биоинформатики
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Алексеевский А.В. Ответственные исполнители: Потапова Т.В., Плетюшкина О.Ю., Попова Л.Б., Спирин С.А., Дугина В.Б. Участники НИР: Попов Д.А., Зиновкина Л.А., Чернявский Д.А., Приходько А.С., Диброва Д.В., Мошенский Д.М., Павлова Г.А., Дугина В.Б., Ириоглов Р.А., Домнина Л.В., Зиновкин Р.А., Пирожков Е.В., Смиренина Л.К., Сарайкин С.С., Русинов И.С., Потапова Т.В., Платко О.Н., Яшанова Л.А., Попова Л.Б., Спирин С.А., Панчин Ю.В., Головин А.В., Леонтович А.М., Фокина А.С., Гофман Д.К., Романов А.В., Фетисова Е.К., Таран А.С., Жаров В.Б., Савченко И.М., Жаров В.Б., Перехватов В.В., Баринова О.А., Никитин И.Д., Штратникова В.Ю., Ершова А.С., Челомбитько М.А., Попова Е.Н., Воронов Д.А., Макарикова О.Л., Кирпиченко А.О., Чуркина А.С., Шагиева Г.С., Карягина-Жулина А.С., Занегина О.Н., Смирнов М.С., Сорочкина А.И., Павлюченкова А.Н., Бойцова Л.Ю., Мейзеров Е.С., Черкашина А.А., Синещекова Д.А., Каштанова А.В., Самохина М.Е., Пирусская А.М., Кондратенко Н.Д., Воейкова А.В., Бабаян Б.А., Волобуева М.Е., Волобуева Т.А., Макиевская К.И., Иванова О.Ю., Плетюшкина О.Ю., Селифонов И.В., Бабаян Б.А., Левушкина Ю.Г., Титова Е.В., Вирясова Г.М., Игнатова Т.Ю., Смолина Г.Б., Галкин И.И., Дунина-Барковская А.Я.
-
- 1 января 2017 - 31 декабря 2021 Новые витальные флуоресцентные зонды для изучения перекисного окисления кардиолипина во внутренней мембране митохондрий: от модельных мембран до живых клеток
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Мулкиджанян А.Я. Ответственные исполнители: Сумбатян Н.В., Диброва Д.В., Лямзаев К.Г. Участники НИР: Пантелеева А.А., Токарчук А.В., Шалаева Д.Н.
-
- 1 января 2015 - 31 декабря 2018 Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
- Ректорат
- Руководитель: Садовничий В.А. Ответственный исполнитель: Каменский П.А. Участники НИР: Эльдаров Ч.М., Мулкиджанян А.Я., Лопатина Ю.В., Кокаева Л.Ю., Александрова А.В., Северова Е.Э., Юрцева О.В., Сулимов А.В., Нетрусов А.И., Нагаев Б.Э., Бондарева Э.А., Крускоп С.В., Калякин М.В., Малахов В.В., Щелкунов М.И., Кулебякина М.А., Кочкин Д.В., Рамонова А.А., Добров Б.В., Ашапкин В.В., Белевич Т.А., Савицкий В.Ю., Носов А.М., Мельникова М.Н., Бабенко В.А., Оболенская Е.В., Арифулин Е.А., Томкович П.С., Просвиров А.С., Волкова О.С., Кутузова И.А., Аксянов Е.А., Недоспасов С.А., Гавриленко С.М., Рыжов А.Л., Попова С.С., Петракова О.С., Нанова О.Г., Пугачева Т.Т., Назаров Р.А., Кнорре Д.А., Гомыранов И.А., Манских В.Н., Лубнина Н.В., Головин А.В., Гололобова М.А., Балацкий А.В., Кручинин П.А., Самоходская Л.М., Королев Д.Е., Храмова Ю.В., Скулачев К.В., Аляутдинов А.Р., Ефименко А.Ю., Поляков М.П., Панина О.Б., Алексеевский А.В., Варлыгина Т.И., Чубатова Н.В., Редькин Я.А., Сорокин М.И., Мунтян М.С., Дыйканов Д.Т., Попов В.С., Емельянова Л.Г., Горшкова Е.А., Малютина А.М., Панютина А.А., Леонтьева О.А., Данилович И.Л., Сухоруков А.П., Конюхов И.В., Вилкул Е.А., Гофман Д.К., Гусев Ф.Е., Жадан А.Э., Князева А.А., Королева А.Т., Вархотов Т.А., Макарова Н.Е., Новаковский Г.Э., Олейникова О.В., Перехватов В.В., Качалкин А.В., Кручинина А.П., Шаталкин А.И., Манахов А.Д., Максимова И.А., Плетюшкина О.Ю., Бычков А.Ю., Федосов В.Э., Евтеев А.А., Герасимов Е.С., Троицкий А.В., Камалов А.А., Маркина М.М., Владыченская И.П., Никитин М.А., Куприянова Е.В., Степанов А.Л., Федоров В.В., Чурикова О.А., Маркова О.В., Тащилова А.С., Плеханова О.С., Григорьева О.А., Захаров К.В., Беме И.Р., Новоселецкий В.Н., Ванюшин Б.Ф., Мелихова Е.В., Орлов Д.С., Крайнов В.Н., Бушуев А.В., Cоина В.С., Аласания К.Ю., Дудова К.В., Вайс В.Б., Черняк Б.В., Савилова З.Д., Ильина И.Ю., Лобакова Е.С., Терехова В.А., Манучарова Н.А., Савченко А.С., Попкова Е.Г., Овченков Е.А., Михайлов К.В., Боброва В.К., Челомбитько М.А., Клёнова А.В., Полянская Л.М., Антал Т.К., Серегин А.П., Москаленко В.Н., Волцит О.В., Огурцов С.В., Шафеи Р.А., Дуброва М.С., Парфёнова Е.В., Банникова А.А., Морковин А.А., Васильева С.Г., Сперанская А.С., Павлинов И.Я., Адельянов А.М., Сенченков Е.П., Семин В.Н., Павлова Н.С., Шалаева Д.Н., Кремнёв С.В., Копылов-Гуськов Ю.О., Сысоева В.Ю., Вангели И.М., Георгиев А.А., Милютина И.А., Аксенова В.А., Воронко О.В., Смирнова Е.А., Римская-Корсакова Н.Н., Ежова О.В., Алёшин В.В., Еланский С.Н., Чивкунова О.Б., Олейникова О.В., Мурашев И.А., Онищенко Г.Е., Сидоренко Г.Ю., Лазарев Е.Н., Волкова О.А., Логачёва М.Д., Аксенова А.А., Гаранина А.С., Фырнин Д.М., Галкин И.И., Лисовский А.А., Керимов А.Б., Шуленина Н.Э., Петушкова Ю.А., Ганчарова О.С., Озеров А.Л., Вайпан Д.В., Шиловский Г.А., Брызгалина Е.В., Елумеева Т.Г., Яворская М.И., Коновалова О.П., Павлов С.Д., Бакеева Л.Е., Неретин Н.Ю., Кутуева Л.И., Александрушкина Н.А., Рубина К.А., Виноградова Е.Н., Шведчикова Н.К., Игнатова Е.А., Аверина О.А., Грицышин В.А., Землемерова Е.Д., Синев А.Ю., Антонова И.И., Тузов К.А., Иваницкая О.Н., Онипченко В.Г., Касумян А.О., Сото Э., Штратникова В.Ю., Кондакова О.А., Вальехо-Роман К.М., Груздева М.А., Левик Л.Ю., Еремичев Р.Ю., Шайтан К.В., Дегтярева Г.В., Ильинская О.П., Ефимов С.В., Иваницкий В.В., Флегонтов П.Н., Титова М.В., Цетлин А.Б., Лукьянов А.А., Распопова А.А., Федосеева (Бандолина) Е.В., Баринова Н.Н., Васильева Е.Д., Ахметжанова А.А., Тарнопольская М.Е., Михайлов К.Г., Климчук О.И., Романова Е.С., Сулимов В.Б., Рысенкова К.Д., Акопян Ж.А., Павлов Д.С., Грум-Гржимайло О.А., Биланенко Е.Н., Иваненко В.Н., Семенова Л.Р., Селях И.О., Кузнецов А.Г., Галинская Т.В., Антоновская А.А., Марфенина О.Е., Бугров Д.И., Самойлов К.Ю., Шахпаронов В.В., Якушев А.Г., Галоян Э.А., Фетисова Е.К., Александров В.В., Шубина Е.А., Самсонов Т.Е., Шагиева Г.С., Колбасов Г.А., Мурашев В.В., Чеканов К.А., Бедарева И.В., Глаголева Е.С., Фенюк Б.А., Романов А.А., Савкин И.А., Иванова А.Е., Федорова А.В., Гоголева С.С., Токарчук А.В., Поярков Н.А., Диброва Д.В., Нестеренко А.М., Криницына А.А., Соловченко А.Е., Скулачев В.П., Терентьева Е.И., Хайлова Л.С., Соловьева Е.Н., Русинов И.С., Лапыгина Е.В., Баулина О.И., Горелова О.А., Рогаев Е.И., Чесунов А.В., Армеев Г.А., Бубнова Е.Н., Лебедев В.С., Шнырева А.В., Водопьянов С.С., Климович П.С., Марова-Кляйнбуб И.М., Лисенкова А.А., Абрамов С.М., Романова Е.С., Семенова М.Л., Нилова М.В., Квятковский А.Л., Добровольская Т.Г., Квятковский А.Я., Кошелева Н.В., Кулебякин К.Ю., Брагина Е.Е., Лапашина А.С., Тужилин А.А., Горюнов Д.В., Игнатов М.С., Стамбольский Д.В., Ревина Д.Б., Шилов Е.С., Яковенко С.А., Румянцев В.Ю., Темерева Е.Н., Лукашевич Н.В., Дроздова О.Ю., Чудаев Д.А., Бенедиктов А.А., Чотчаева Ф.Р., Лемак С.С., Григорьева А.А., Решетников Р.В., Березина Н.Я., Симонян Р.А., Лысак Л.В., Арушанян И.О., Пенин А.А., Бондаренко Г.Н., Дудов С.В., Твердислов В.А., Зубкова Е.Н., Симоненко Е.Ю., Семина Е.В., Бисерова Н.М., Озрина Р.Д., Погосян С.И., Зайцева А.А., Петров П.Н., Орловский И.В., Чертопруд Е.С., Попова Е.Н., Полилов А.А., Слободкина Е.А., Попеленский Ф.Ю., Семенова А.В., Петров Н.Б., Старостина Е.Е., Чертополохов В.А., Яровая Е.Б., Самигуллин Т.Х., Русин Л.Ю., Зернов А.С., Воронина Е.Ю., Ворцепнева Е.В., Корсуновская О.С., Поздняков Л.А., Полевова С.В., Кутов Д.К., Година Е.З., Тимошенко В.Ю., Назаров П.А., Тихонов В.В., Агеева Л.В., Кобельков Г.М., Кураков А.В., Щербаков П.Н., Кобельков С.Г., Шестаков А.И., Васильев А.Н., Сенчукова А.Л., Иванов А.О., Новаковский Г.Э., Черепанов Д.А., Кузищин К.В., Маслакова А.А., Каткова Е.В., Мохова Е.Н., Крупицкий А.В., Лысков Д.Ф., Глушакова А.М., Азовский А.И., Артюшин И.В., Чернов И.Ю., Федоров А.В., Благовещенская Е.Ю., Неретина Т.В., Антохина О.Г., Птушенко В.В., Спирин С.А., Карапетян М.К., Пивоваров Е.А., Кушунина М.А., Бацевич В.А., Крамина Т.Е., Шаранова Н.Э., Спасская Н.Н., Мартынов А.В., Колесниченко К.А., Виноградская М.И., Коршунова Т.А., Екимова И.А., Андреева Т.В., Шайтан А.К., Колбасова Г.Д., Тишечкин Д.Ю., Ерохина М.В., Александрушкина Н.И., Воробьева Е.А., Новоселецкая Е.С., Жирков И.А., Суханова Е.С., Бызов Б.А., Савицкая М.А., Дьяков М.Ю., Мазей Ю.А., Коршунова Г.А., Сумбатян Н.В., Высоких М.Ю., Якушев А.В., Шаталова Н.Н., Гмошинский В.И., Нимирицкий П.П., Борисанова А.О., Бычкова Е.Ю., Григорьев Ф.В., Николаева О.В.
-
- 25 августа 2014 - 31 декабря 2018 Молекулярные механизмы преобразования энергии при бактериальном окислительном фосфорилировании
- Отдел молекулярной энергетики микроорганизмов
- Руководитель: Богачев А.В. Участники НИР: Лапашина А.С., Костырко В.А., Приходько А.С., Байков А.А., Берцова Ю.В., Мамедов А., Анашкин В.А., Романов Р.С., Диброва Д.В., Серебрякова М.В., Фенюк Б.А., Кнорре Д.А.
-
- 1 мая 2014 - 1 мая 2017 Реконструкция эволюции биологических мембран методом филогеномного анализа
- Фонд Дмитрия Зимина «Династия»
- Руководитель: Диброва Д.В.
-
- 1 января 2013 - 31 декабря 2018 Математика и её применение в биологии и медицине. Биоинформатика
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Алексеевский А.В. Участники НИР: Попов Д.А., Аксянов Е.А., Диброва Д.В., Мошенский Д.М., Хачатурян М.А., Русинов И.С., Головин А.В., Спирин С.А., Леонтович А.М., Королев Д.Е., Баринова О.А., Штратникова В.Ю., Ершова А.С., Мейзеров Е.С., Карягина-Жулина А.С., Андреева Н.В., Сафонов Н.А., Чернявский Д.А., Занегина О.Н.
-
- 23 июня 2010 - 31 декабря 2012 Нано-электростатика границ раздела фаз в биологических объектах
- Руководитель: Скулачев В.П. Участники НИР: Боздаганян М.Е., Федоркин О.Н., Диброва Д.В., Черепанов Д.А., Лохматиков А.В., Кирилюк И.А.
-
- 1 июня 2010 - 31 декабря 2011 Разработка методов исследования взаимодействия кардиолипина с цитохромным bc1 комплексом митохондрий млекопитающих
- Руководитель: Мулкиджанян А.Я. Участники НИР: Боздаганян М.Е., Федоркин О.Н., Шайтан А.К., Замятнин А.А., Симонян Р.А., Ташлицкий В.Н., Диброва Д.В., Черепанов Д.А., Пустовидко А.В., Лохматиков А.В., Терещенков А.Г., Лямзаев К.Г.
Членство в научных обществах
Диссертации
-
- 2013 Phylogenomic analysis of energy converting enzymes (Филогеномный анализ энергопреобразующих ферментов)
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.09 - Математическая биология, биоинформатика (биол. науки)
- Автор: Диброва Д.В., к.б.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
- Научный руководитель: Мулкиджанян А.Я., д.б.н., доц., МГУ имени М.В. Ломоносова
- Защищена в совете при Университет г. Оснабрюка (Osnabrück University)
- Организация, в которой выполнялась работа: Университет г. Оснабрюка (Osnabrück University)
Руководство дипломными работами
-
- 2023 Применение методов машинного обучения к поиску переносчиков натрия
- Научные руководители: Диброва Дарья Владимировна, Мулкиджанян Армен Яковлевич
- Автор: Бушмакин Илья Михайлович (Специалист)
-
- 2019 Биоинформатический анализ прокариотических АТФаз F- и N-типа
- Научные руководители: Фенюк Б.А., Диброва Д.В.
- Автор: Холина Татьяна Дмитриевна (Специалист)
-
- 2018 Применение полуавтоматической классификации способов связывания наиболее распространенных белковых кофакторов для характеристики универсальных и вариабельных паттернов связывания
- Научный руководитель: Диброва Дарья Владимировна
- Автор: Козлова Мария Ильинична (Специалист)
-
- 2017 Улучшение алгоритма построения множественного выравнивания для мембранных белков с использование вероятностного подхода
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Герман Эдуардович Новаковский (Специалист)
-
- 2017 Разработка программы для сравнительного анализа геномного контекста прокариотических генов и ее использование для предсказания новых белковых комплексов
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)
Руководство курсовыми работами
-
- 2023 Филогеномный анализ каталитической α1-субъединицы натрий-транслоцирующей декарбоксилазы
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Ахтямова Карина Тимуровна (Специалист)
-
- 2023 Филогеномный анализ коротких мембранных субъединиц НАДН:хинон оксидоредуктазы 1 типа
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Ерина Алина Вячеславовна (Специалист)
-
- 2023 Филогеномный и сравнительно-структурный анализ мембранной субъединицы натриевой декарбоксилазы
- Научные руководители: Мулкиджанян А.Я., Диброва Д.В.
- Автор: Агеева Виктория Сергеевна (Специалист)
-
- 2023 Филогеномное исследование мембранных а/I-субъединиц роторной АТФазы
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Сафонова Варвара Павловна (Специалист)
-
- 2023 Филогеномный анализ переносящих ионы мембранных субъединиц НАДН:хинон оксидоредуктазы 1 типа
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Михайлова Екатерина Сергеевна (Специалист)
-
- 2023 Филогеномный анализ эукариотических обонятельных рецепторов, сопряженных с G-белком
- Научные руководители: Диброва Дарья Владимировна, Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Рохин Илья Андреевич (Специалист)
-
- 2021 Филогеномный анализ переносчиков натрия у прокариот
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Бушмакин Илья Михайлович (Специалист)
-
- 2020 Сравнительный структурный анализ катион-переносящих мембранных субъединиц роторных АТФаз бактерий и эукариот
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Антоненкова Юлия Станиславовна (Специалист)
-
- 2019 Анализ сайта связывания катиона в I-субъединице роторных мембранных V-АТФаз
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Антоненкова Юлия Станиславовна (Специалист)
-
- 2019 Анализ эволюционных взаимоотношений Melainabacteria, Cyanobacteria, Margulisbacteria и Sericytochromatia на основании анализа сайта связывания катиона в с-субъединице роторных мембранных АТФаз
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Беляева Юлия Дмитриевна (Специалист)
-
- 2019 Филогеномный анализ ферментов биосинтеза мембранных липидов у суперфилума Асгард
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Потапенко Елена Юрьевна (Специалист)
-
- 2019 Поиск корреляций между кластерами ортологичных групп и типом биоэнергетики организма
- Научные руководители: Диброва Д.В., Мулкиджанян А.Я.
- Автор: Бушмакин Илья Михайлович (Специалист)
-
- 2017 Описание, классификация и эволюция способов связывания основных белковых кофакторов
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Мария Ильинична Козлова (Специалист)
-
- 2016 Полуавтоматический анализ конформаций редокс-кофакторов и их окружения в трехмерных структурах белков
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Мария Ильинична Козлова (Специалист)
-
- 2016 Филогеномный анализ симпортеров желчных кислот и моновалентных катионов (ионов Na+ или протонов)
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Дарья Викторовна Горбачева (Специалист)
-
- 2016 Исследование возможности повышения качества множественного выравнивания в локальных участках за счет алгоритма последовательного добавления новых последовательностей к выравниванию меньшего объема
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Алексей Владимирович Елисеев (Специалист)
-
- 2016 Филогеномный анализ симпортеров сахаров и моновалентных катионов (ионов Na+ или протонов)
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Анастасия Александровна Князева (Специалист)
-
- 2016 Филогеномный анализ симпортеров дикарбоновых кислот и моновалентных катионов (ионов Na+ или протонов)
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Надежда Евгеньевна Макарова (Специалист)
-
- 2016 Анализ и сравнение работы программ, предсказывающих границы генов
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Анна Алексеевна Желудкевич (Специалист)
-
- 2016 Отработка алгоритма построения множественного выравнивания для мембранных белков
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Герман Эдуардович Новаковский (Специалист)
-
- 2016 Анализ геномного контекста ферментов дыхательных цепей прокариот
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)
-
- 2015 Анализ коррелирующих мутаций в каталитических субъединицах роторной мембранной АТФ-синтазы
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Филипп Олегович Гусев (Специалист)
-
- 2015 Филогеномный анализ домена NB-ARC из белка Apaf-1
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Мария Ильинична Козлова (Специалист)
-
- 2015 Филогеномный анализ FpoF субъединицы F420 дегидрогеназы
- Научный руководитель: Дарья Владимировна Диброва
- Автор: Анна Алексеевна Желудкевич (Специалист)
-
- 2015 Филогеномный анализ НАДН:хинон оксидоредуктазы I типа
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Герман Эдуардович Новаковский (Специалист)
-
- 2015 Разработка программы OLESA (Operon Loci Examination and Sorting Application) для анализа расположения генов в прокариотических геномах
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)
-
- 2014 Филогеномный анализ мембранных Na+-транслоцирующих декарбоксилаз
- Научные руководители: Дарья Владимировна Диброва, Армен Яковлевич Мулкиджанян
- Автор: Олеся Игоревна Климчук (Специалист)
Авторство учебных курсов
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Карягина А.С., Спирин С.А., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Спирин С.А., Карягина А.С., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Алексеевский А.В.
-
- 2014 МФК Биоинформатика
- Авторы: Алексеевский А.В., Спирин С.А., Карягина-Жулина А.С., Гельфанд М.С., Потапова Н.А., Жарикова А.А., Диброва Д.В., Злобин А.С.
-
- 2012 Практическая информатика
- Авторы: Алексеевский А.В., Спирин С.А., Диброва Д.В., Митрофанов С.И.
-
- 2003 Биоинформатика 1 курс
- Авторы: Алексеевский А.В., Спирин С.А., Аксянов Е.А., Диброва Д.В., Нагаев Б.Э., Русинов И.С.
Преподавание учебных курсов
-
- 19 октября 2023 - 28 декабря 2023 Биоинформатика и компьютерные алгоритмы
- МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики
- факультативная, лекции, 18 часов
-
- 17 октября 2023 - 24 октября 2023 Биоинформатика 2 курс
- МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики
- обязательная, базовой части, практические занятия, 4 часов
-
- 10 февраля 2023 - 12 мая 2023 Биоинформатика 2 курс
- МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики
- обязательная, базовой части, практические занятия, 5 часов
-
- 1 сентября 2022 - 31 декабря 2022 Практическая биоинформатика
- МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики
- обязательная, базовой части, лекции, 16 часов